Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Serpina1cQ00896 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Serpina1cQ00896 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Serpina1cQ00896 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Serpina1cQ00896 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Serpina1cQ00896 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Serpina1cQ00896 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Serpina1cQ00896 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Serpina1cQ00896 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Serpina1cQ00896 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Serpina1cQ00896 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Serpina1cQ00896 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Serpina1cQ00896 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Serpina1cQ00896 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Serpina1cQ00896 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Serpina1cQ00896 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Serpina1cQ00896 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Serpina1cQ00896 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Serpina1cQ00896 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Serpina1cQ00896 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Serpina1cQ00896 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Serpina1cQ00896 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Serpina1cQ00896 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Serpina1cQ00896 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Serpina1cQ00896 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Serpina1cQ00896 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Serpina1cQ00896 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Serpina1cQ00896 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Serpina1cQ00896 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Serpina1cQ00896 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Serpina1cQ00896 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Serpina1cQ00896 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Serpina1cQ00896 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Serpina1cQ00896 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Serpina1cQ00896 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Serpina1cQ00896 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Serpina1cQ00896 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Serpina1cQ00896 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Serpina1cQ00896 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Serpina1cQ00896 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Serpina1cQ00896 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Serpina1cQ00896 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Serpina1cQ00896 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Serpina1cQ00896 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Serpina1cQ00896 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Serpina1cQ00896 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Serpina1cQ00896 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Serpina1cQ00896 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Serpina1cQ00896 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Serpina1cQ00896 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Serpina1cQ00896 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Serpina1cQ00896 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Serpina1cQ00896 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Serpina1cQ00896 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Serpina1cQ00896 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Serpina1cQ00896 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Serpina1cQ00896 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Serpina1cQ00896 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Serpina1cQ00896 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Serpina1cQ00896 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Serpina1cQ00896 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Serpina1cQ00896 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Serpina1cQ00896 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Serpina1cQ00896 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Serpina1cQ00896 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Serpina1cQ00896 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Serpina1cQ00896 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Serpina1cQ00896 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Serpina1cQ00896 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Serpina1cQ00896 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Serpina1cQ00896 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Serpina1cQ00896 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Serpina1cQ00896 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Serpina1cQ00896 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Serpina1cQ00896 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Serpina1cQ00896 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Serpina1cQ00896 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Serpina1cQ00896 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Serpina1cQ00896 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Serpina1cQ00896 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Serpina1cQ00896 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Serpina1cQ00896 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Serpina1cQ00896 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Serpina1cQ00896 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Serpina1cQ00896 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Serpina1cQ00896 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Serpina1cQ00896 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Serpina1cQ00896 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Serpina1cQ00896 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Serpina1cQ00896 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Serpina1cQ00896 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Serpina1cQ00896 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Serpina1cQ00896 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Serpina1cQ00896 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Serpina1cQ00896 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Serpina1cQ00896 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Serpina1cQ00896 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Serpina1cQ00896 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Serpina1cQ00896 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Serpina1cQ00896 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms