Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Lama4P97927 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Lama4P97927 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Lama4P97927 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Lama4P97927 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Lama4P97927 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lama4P97927 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Lama4P97927 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lama4P97927 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lama4P97927 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lama4P97927 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lama4P97927 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Lama4P97927 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Lama4P97927 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lama4P97927 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lama4P97927 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lama4P97927 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lama4P97927 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Lama4P97927 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Lama4P97927 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Lama4P97927 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lama4P97927 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lama4P97927 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lama4P97927 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lama4P97927 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lama4P97927 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Lama4P97927 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Lama4P97927 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Lama4P97927 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Lama4P97927 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Lama4P97927 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lama4P97927 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lama4P97927 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lama4P97927 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lama4P97927 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Lama4P97927 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Lama4P97927 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lama4P97927 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Lama4P97927 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lama4P97927 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Lama4P97927 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lama4P97927 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lama4P97927 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lama4P97927 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Lama4P97927 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lama4P97927 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lama4P97927 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lama4P97927 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Lama4P97927 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lama4P97927 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lama4P97927 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lama4P97927 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lama4P97927 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lama4P97927 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Lama4P97927 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lama4P97927 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lama4P97927 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lama4P97927 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Lama4P97927 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lama4P97927 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lama4P97927 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lama4P97927 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Lama4P97927 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Lama4P97927 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Lama4P97927 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Lama4P97927 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Lama4P97927 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Lama4P97927 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Lama4P97927 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Lama4P97927 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Lama4P97927 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lama4P97927 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Lama4P97927 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lama4P97927 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lama4P97927 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lama4P97927 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Lama4P97927 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Lama4P97927 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lama4P97927 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lama4P97927 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lama4P97927 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Lama4P97927 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Lama4P97927 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lama4P97927 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lama4P97927 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lama4P97927 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lama4P97927 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Lama4P97927 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Lama4P97927 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lama4P97927 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lama4P97927 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lama4P97927 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lama4P97927 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Lama4P97927 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Lama4P97927 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lama4P97927 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lama4P97927 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Lama4P97927 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Lama4P97927 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Lama4P97927 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms