Protein–RNA interactions for Protein: P86174

Bend4, BEN domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend4P86174 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Bend4P86174 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Bend4P86174 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Bend4P86174 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Bend4P86174 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Bend4P86174 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Bend4P86174 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Bend4P86174 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Bend4P86174 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Bend4P86174 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Bend4P86174 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Bend4P86174 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Bend4P86174 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Bend4P86174 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Bend4P86174 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Bend4P86174 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Bend4P86174 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Bend4P86174 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Bend4P86174 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Bend4P86174 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Bend4P86174 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Bend4P86174 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Bend4P86174 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Bend4P86174 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Bend4P86174 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Bend4P86174 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Bend4P86174 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Bend4P86174 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Bend4P86174 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Bend4P86174 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Bend4P86174 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Bend4P86174 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Bend4P86174 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Bend4P86174 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Bend4P86174 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Bend4P86174 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Bend4P86174 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Bend4P86174 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Bend4P86174 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Bend4P86174 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Bend4P86174 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Bend4P86174 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Bend4P86174 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Bend4P86174 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Bend4P86174 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Bend4P86174 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Bend4P86174 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Bend4P86174 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Bend4P86174 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Bend4P86174 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Bend4P86174 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Bend4P86174 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Bend4P86174 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Bend4P86174 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Bend4P86174 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Bend4P86174 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Bend4P86174 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Bend4P86174 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Bend4P86174 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Bend4P86174 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Bend4P86174 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Bend4P86174 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Bend4P86174 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Bend4P86174 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Bend4P86174 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Bend4P86174 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Bend4P86174 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Bend4P86174 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Bend4P86174 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Bend4P86174 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Bend4P86174 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Bend4P86174 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Bend4P86174 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Bend4P86174 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Bend4P86174 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Bend4P86174 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Bend4P86174 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Bend4P86174 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Bend4P86174 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Bend4P86174 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Bend4P86174 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Bend4P86174 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Bend4P86174 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Bend4P86174 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Bend4P86174 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Bend4P86174 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Bend4P86174 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Bend4P86174 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Bend4P86174 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Bend4P86174 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Bend4P86174 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Bend4P86174 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Bend4P86174 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Bend4P86174 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Bend4P86174 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Bend4P86174 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Bend4P86174 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Bend4P86174 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Bend4P86174 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Bend4P86174 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms