Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc9a3r1P70441 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc9a3r1P70441 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc9a3r1P70441 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9a3r1P70441 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc9a3r1P70441 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc9a3r1P70441 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc9a3r1P70441 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc9a3r1P70441 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc9a3r1P70441 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc9a3r1P70441 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Slc9a3r1P70441 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc9a3r1P70441 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Slc9a3r1P70441 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc9a3r1P70441 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Slc9a3r1P70441 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Slc9a3r1P70441 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Slc9a3r1P70441 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Slc9a3r1P70441 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Slc9a3r1P70441 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Slc9a3r1P70441 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Slc9a3r1P70441 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc9a3r1P70441 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Slc9a3r1P70441 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Slc9a3r1P70441 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc9a3r1P70441 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Slc9a3r1P70441 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Slc9a3r1P70441 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc9a3r1P70441 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Slc9a3r1P70441 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slc9a3r1P70441 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slc9a3r1P70441 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc9a3r1P70441 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc9a3r1P70441 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc9a3r1P70441 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slc9a3r1P70441 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc9a3r1P70441 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc9a3r1P70441 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc9a3r1P70441 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc9a3r1P70441 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Slc9a3r1P70441 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc9a3r1P70441 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Slc9a3r1P70441 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9a3r1P70441 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc9a3r1P70441 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9a3r1P70441 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9a3r1P70441 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc9a3r1P70441 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9a3r1P70441 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc9a3r1P70441 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Slc9a3r1P70441 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc9a3r1P70441 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc9a3r1P70441 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc9a3r1P70441 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc9a3r1P70441 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc9a3r1P70441 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9a3r1P70441 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9a3r1P70441 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9a3r1P70441 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc9a3r1P70441 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc9a3r1P70441 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc9a3r1P70441 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9a3r1P70441 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc9a3r1P70441 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc9a3r1P70441 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc9a3r1P70441 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc9a3r1P70441 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc9a3r1P70441 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc9a3r1P70441 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9a3r1P70441 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc9a3r1P70441 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc9a3r1P70441 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc9a3r1P70441 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc9a3r1P70441 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc9a3r1P70441 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a3r1P70441 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slc9a3r1P70441 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc9a3r1P70441 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc9a3r1P70441 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc9a3r1P70441 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Slc9a3r1P70441 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc9a3r1P70441 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc9a3r1P70441 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc9a3r1P70441 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc9a3r1P70441 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Slc9a3r1P70441 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc9a3r1P70441 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc9a3r1P70441 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc9a3r1P70441 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc9a3r1P70441 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc9a3r1P70441 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc9a3r1P70441 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc9a3r1P70441 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc9a3r1P70441 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc9a3r1P70441 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc9a3r1P70441 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc9a3r1P70441 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc9a3r1P70441 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a3r1P70441 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc9a3r1P70441 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms