Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cdh9P70407 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cdh9P70407 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdh9P70407 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cdh9P70407 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cdh9P70407 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdh9P70407 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdh9P70407 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdh9P70407 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdh9P70407 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdh9P70407 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdh9P70407 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdh9P70407 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cdh9P70407 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cdh9P70407 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdh9P70407 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cdh9P70407 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cdh9P70407 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cdh9P70407 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cdh9P70407 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cdh9P70407 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdh9P70407 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cdh9P70407 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cdh9P70407 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cdh9P70407 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdh9P70407 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdh9P70407 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdh9P70407 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdh9P70407 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdh9P70407 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdh9P70407 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdh9P70407 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdh9P70407 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdh9P70407 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdh9P70407 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdh9P70407 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdh9P70407 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdh9P70407 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdh9P70407 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cdh9P70407 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cdh9P70407 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdh9P70407 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdh9P70407 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cdh9P70407 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdh9P70407 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdh9P70407 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdh9P70407 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdh9P70407 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdh9P70407 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdh9P70407 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdh9P70407 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdh9P70407 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdh9P70407 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdh9P70407 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdh9P70407 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdh9P70407 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdh9P70407 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdh9P70407 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdh9P70407 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdh9P70407 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cdh9P70407 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdh9P70407 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdh9P70407 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdh9P70407 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdh9P70407 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdh9P70407 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdh9P70407 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdh9P70407 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdh9P70407 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh9P70407 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh9P70407 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdh9P70407 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdh9P70407 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdh9P70407 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdh9P70407 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdh9P70407 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cdh9P70407 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdh9P70407 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cdh9P70407 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh9P70407 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh9P70407 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdh9P70407 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh9P70407 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdh9P70407 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cdh9P70407 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdh9P70407 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh9P70407 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh9P70407 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cdh9P70407 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdh9P70407 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdh9P70407 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdh9P70407 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdh9P70407 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cdh9P70407 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdh9P70407 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdh9P70407 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdh9P70407 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdh9P70407 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdh9P70407 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdh9P70407 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms