Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Plxna3P70208 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Plxna3P70208 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Plxna3P70208 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Plxna3P70208 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Plxna3P70208 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Plxna3P70208 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Plxna3P70208 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Plxna3P70208 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Plxna3P70208 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Plxna3P70208 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Plxna3P70208 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Plxna3P70208 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Plxna3P70208 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Plxna3P70208 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Plxna3P70208 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Plxna3P70208 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Plxna3P70208 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Plxna3P70208 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Plxna3P70208 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Plxna3P70208 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Plxna3P70208 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Plxna3P70208 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Plxna3P70208 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Plxna3P70208 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Plxna3P70208 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Plxna3P70208 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Plxna3P70208 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Plxna3P70208 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Plxna3P70208 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Plxna3P70208 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Plxna3P70208 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Plxna3P70208 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Plxna3P70208 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Plxna3P70208 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Plxna3P70208 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Plxna3P70208 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Plxna3P70208 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plxna3P70208 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plxna3P70208 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Plxna3P70208 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Plxna3P70208 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Plxna3P70208 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Plxna3P70208 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Plxna3P70208 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Plxna3P70208 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Plxna3P70208 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Plxna3P70208 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Plxna3P70208 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Plxna3P70208 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Plxna3P70208 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Plxna3P70208 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plxna3P70208 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plxna3P70208 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Plxna3P70208 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Plxna3P70208 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Plxna3P70208 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Plxna3P70208 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plxna3P70208 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Plxna3P70208 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Plxna3P70208 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Plxna3P70208 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plxna3P70208 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Plxna3P70208 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Plxna3P70208 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plxna3P70208 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plxna3P70208 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plxna3P70208 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plxna3P70208 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Plxna3P70208 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plxna3P70208 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Plxna3P70208 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plxna3P70208 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Plxna3P70208 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plxna3P70208 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plxna3P70208 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Plxna3P70208 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plxna3P70208 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Plxna3P70208 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plxna3P70208 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Plxna3P70208 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plxna3P70208 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Plxna3P70208 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Plxna3P70208 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plxna3P70208 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plxna3P70208 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Plxna3P70208 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plxna3P70208 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Plxna3P70208 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Plxna3P70208 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plxna3P70208 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.8 ms