Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uba52P62984 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uba52P62984 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uba52P62984 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uba52P62984 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Uba52P62984 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uba52P62984 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Uba52P62984 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba52P62984 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uba52P62984 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uba52P62984 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uba52P62984 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uba52P62984 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uba52P62984 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uba52P62984 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Uba52P62984 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Uba52P62984 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uba52P62984 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uba52P62984 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uba52P62984 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uba52P62984 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uba52P62984 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uba52P62984 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uba52P62984 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uba52P62984 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Uba52P62984 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uba52P62984 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uba52P62984 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba52P62984 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba52P62984 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uba52P62984 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uba52P62984 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Uba52P62984 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba52P62984 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba52P62984 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba52P62984 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba52P62984 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uba52P62984 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba52P62984 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uba52P62984 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uba52P62984 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uba52P62984 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uba52P62984 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uba52P62984 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uba52P62984 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uba52P62984 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Uba52P62984 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uba52P62984 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uba52P62984 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uba52P62984 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uba52P62984 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uba52P62984 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uba52P62984 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uba52P62984 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uba52P62984 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Uba52P62984 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uba52P62984 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uba52P62984 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uba52P62984 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uba52P62984 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uba52P62984 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uba52P62984 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uba52P62984 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Uba52P62984 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uba52P62984 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uba52P62984 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uba52P62984 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uba52P62984 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uba52P62984 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uba52P62984 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uba52P62984 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uba52P62984 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uba52P62984 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uba52P62984 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba52P62984 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba52P62984 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba52P62984 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba52P62984 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uba52P62984 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uba52P62984 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Uba52P62984 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uba52P62984 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Uba52P62984 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uba52P62984 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uba52P62984 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uba52P62984 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Uba52P62984 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uba52P62984 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uba52P62984 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uba52P62984 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms