Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gabra1P62812 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabra1P62812 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabra1P62812 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabra1P62812 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabra1P62812 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabra1P62812 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabra1P62812 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra1P62812 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gabra1P62812 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Gabra1P62812 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gabra1P62812 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabra1P62812 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gabra1P62812 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabra1P62812 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabra1P62812 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gabra1P62812 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabra1P62812 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabra1P62812 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabra1P62812 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabra1P62812 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabra1P62812 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra1P62812 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabra1P62812 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra1P62812 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gabra1P62812 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra1P62812 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra1P62812 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gabra1P62812 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gabra1P62812 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gabra1P62812 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra1P62812 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra1P62812 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra1P62812 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gabra1P62812 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gabra1P62812 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gabra1P62812 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gabra1P62812 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gabra1P62812 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra1P62812 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabra1P62812 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabra1P62812 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra1P62812 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gabra1P62812 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gabra1P62812 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabra1P62812 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabra1P62812 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabra1P62812 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabra1P62812 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabra1P62812 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabra1P62812 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabra1P62812 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabra1P62812 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabra1P62812 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabra1P62812 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gabra1P62812 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gabra1P62812 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabra1P62812 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabra1P62812 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabra1P62812 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabra1P62812 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gabra1P62812 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabra1P62812 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabra1P62812 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabra1P62812 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabra1P62812 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra1P62812 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra1P62812 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra1P62812 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra1P62812 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabra1P62812 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gabra1P62812 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabra1P62812 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabra1P62812 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gabra1P62812 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra1P62812 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gabra1P62812 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra1P62812 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gabra1P62812 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gabra1P62812 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra1P62812 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms