Protein–RNA interactions for Protein: P61979

Hnrnpk, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpkP61979 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HnrnpkP61979 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HnrnpkP61979 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HnrnpkP61979 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HnrnpkP61979 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HnrnpkP61979 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HnrnpkP61979 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HnrnpkP61979 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HnrnpkP61979 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HnrnpkP61979 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HnrnpkP61979 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HnrnpkP61979 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HnrnpkP61979 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HnrnpkP61979 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HnrnpkP61979 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HnrnpkP61979 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HnrnpkP61979 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HnrnpkP61979 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HnrnpkP61979 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HnrnpkP61979 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HnrnpkP61979 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
HnrnpkP61979 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HnrnpkP61979 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HnrnpkP61979 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HnrnpkP61979 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HnrnpkP61979 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HnrnpkP61979 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HnrnpkP61979 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HnrnpkP61979 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HnrnpkP61979 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HnrnpkP61979 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HnrnpkP61979 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HnrnpkP61979 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HnrnpkP61979 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HnrnpkP61979 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HnrnpkP61979 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HnrnpkP61979 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
HnrnpkP61979 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HnrnpkP61979 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HnrnpkP61979 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HnrnpkP61979 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HnrnpkP61979 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HnrnpkP61979 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HnrnpkP61979 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HnrnpkP61979 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HnrnpkP61979 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HnrnpkP61979 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HnrnpkP61979 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HnrnpkP61979 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HnrnpkP61979 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HnrnpkP61979 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HnrnpkP61979 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HnrnpkP61979 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HnrnpkP61979 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HnrnpkP61979 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HnrnpkP61979 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HnrnpkP61979 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HnrnpkP61979 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HnrnpkP61979 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HnrnpkP61979 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HnrnpkP61979 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HnrnpkP61979 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HnrnpkP61979 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HnrnpkP61979 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HnrnpkP61979 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HnrnpkP61979 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HnrnpkP61979 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HnrnpkP61979 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HnrnpkP61979 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HnrnpkP61979 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HnrnpkP61979 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HnrnpkP61979 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HnrnpkP61979 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HnrnpkP61979 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HnrnpkP61979 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HnrnpkP61979 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HnrnpkP61979 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HnrnpkP61979 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HnrnpkP61979 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HnrnpkP61979 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HnrnpkP61979 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HnrnpkP61979 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HnrnpkP61979 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HnrnpkP61979 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HnrnpkP61979 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HnrnpkP61979 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HnrnpkP61979 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HnrnpkP61979 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HnrnpkP61979 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HnrnpkP61979 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HnrnpkP61979 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HnrnpkP61979 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HnrnpkP61979 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HnrnpkP61979 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HnrnpkP61979 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HnrnpkP61979 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HnrnpkP61979 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HnrnpkP61979 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HnrnpkP61979 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HnrnpkP61979 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms