Protein–RNA interactions for Protein: P55937

Golga3, Golgin subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Golga3P55937 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.34■■■■■ 5.33
Golga3P55937 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.34■■■■■ 5.33
Golga3P55937 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.32■■■■■ 5.33
Golga3P55937 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC48.23■■■■■ 5.31
Golga3P55937 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
Golga3P55937 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.31
Golga3P55937 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.19■■■■■ 5.3
Golga3P55937 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC48.05■■■■■ 5.28
Golga3P55937 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Golga3P55937 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
Golga3P55937 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Golga3P55937 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.82■■■■■ 5.25
Golga3P55937 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Golga3P55937 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.75■■■■■ 5.23
Golga3P55937 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Golga3P55937 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
Golga3P55937 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
Golga3P55937 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Golga3P55937 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
Golga3P55937 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
Golga3P55937 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
Golga3P55937 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
Golga3P55937 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
Golga3P55937 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC47.41■■■■■ 5.18
Golga3P55937 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Golga3P55937 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Golga3P55937 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC47.25■■■■■ 5.15
Golga3P55937 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
Golga3P55937 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
Golga3P55937 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Golga3P55937 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
Golga3P55937 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Golga3P55937 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC47.06■■■■■ 5.12
Golga3P55937 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
Golga3P55937 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.97■■■■■ 5.11
Golga3P55937 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
Golga3P55937 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC46.93■■■■■ 5.1
Golga3P55937 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.92■■■■■ 5.1
Golga3P55937 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC46.92■■■■■ 5.1
Golga3P55937 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.9■■■■■ 5.1
Golga3P55937 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
Golga3P55937 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Golga3P55937 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
Golga3P55937 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Golga3P55937 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
Golga3P55937 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
Golga3P55937 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Golga3P55937 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
Golga3P55937 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Golga3P55937 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Golga3P55937 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
Golga3P55937 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Golga3P55937 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Golga3P55937 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
Golga3P55937 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Golga3P55937 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Golga3P55937 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Golga3P55937 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Golga3P55937 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Golga3P55937 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
Golga3P55937 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
Golga3P55937 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
Golga3P55937 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
Golga3P55937 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Golga3P55937 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
Golga3P55937 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Golga3P55937 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Golga3P55937 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.08■■■■■ 4.97
Golga3P55937 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
Golga3P55937 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Golga3P55937 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
Golga3P55937 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
Golga3P55937 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Golga3P55937 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Golga3P55937 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.95
Golga3P55937 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Golga3P55937 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Golga3P55937 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Golga3P55937 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
Golga3P55937 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Golga3P55937 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Golga3P55937 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.8■■■■■ 4.92
Golga3P55937 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.79■■■■■ 4.92
Golga3P55937 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Golga3P55937 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
Golga3P55937 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
Golga3P55937 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45.78■■■■■ 4.92
Golga3P55937 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC45.73■■■■■ 4.91
Golga3P55937 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC45.7■■■■■ 4.91
Golga3P55937 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
Golga3P55937 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Golga3P55937 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Golga3P55937 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Golga3P55937 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
Golga3P55937 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC45.67■■■■■ 4.9
Golga3P55937 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Golga3P55937 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Golga3P55937 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Golga3P55937 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
Golga3P55937 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms