Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CcnfP51944 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CcnfP51944 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CcnfP51944 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CcnfP51944 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CcnfP51944 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CcnfP51944 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CcnfP51944 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CcnfP51944 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CcnfP51944 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CcnfP51944 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CcnfP51944 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CcnfP51944 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CcnfP51944 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CcnfP51944 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CcnfP51944 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CcnfP51944 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CcnfP51944 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CcnfP51944 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CcnfP51944 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CcnfP51944 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CcnfP51944 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CcnfP51944 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CcnfP51944 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CcnfP51944 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CcnfP51944 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CcnfP51944 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CcnfP51944 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CcnfP51944 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CcnfP51944 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CcnfP51944 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CcnfP51944 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CcnfP51944 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CcnfP51944 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CcnfP51944 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CcnfP51944 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CcnfP51944 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CcnfP51944 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CcnfP51944 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CcnfP51944 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CcnfP51944 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CcnfP51944 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CcnfP51944 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CcnfP51944 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CcnfP51944 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CcnfP51944 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CcnfP51944 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CcnfP51944 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CcnfP51944 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CcnfP51944 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CcnfP51944 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CcnfP51944 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CcnfP51944 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CcnfP51944 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CcnfP51944 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CcnfP51944 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CcnfP51944 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CcnfP51944 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CcnfP51944 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CcnfP51944 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CcnfP51944 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CcnfP51944 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CcnfP51944 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CcnfP51944 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CcnfP51944 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CcnfP51944 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CcnfP51944 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CcnfP51944 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CcnfP51944 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CcnfP51944 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CcnfP51944 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CcnfP51944 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CcnfP51944 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CcnfP51944 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcnfP51944 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcnfP51944 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcnfP51944 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcnfP51944 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CcnfP51944 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CcnfP51944 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CcnfP51944 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CcnfP51944 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CcnfP51944 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CcnfP51944 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CcnfP51944 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CcnfP51944 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CcnfP51944 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CcnfP51944 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CcnfP51944 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CcnfP51944 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CcnfP51944 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CcnfP51944 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CcnfP51944 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CcnfP51944 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CcnfP51944 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CcnfP51944 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CcnfP51944 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CcnfP51944 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CcnfP51944 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CcnfP51944 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms