Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa11P50709 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa11P50709 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa11P50709 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Defa11P50709 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa11P50709 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Defa11P50709 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Defa11P50709 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa11P50709 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Defa11P50709 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa11P50709 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Defa11P50709 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Defa11P50709 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Defa11P50709 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa11P50709 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Defa11P50709 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defa11P50709 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Defa11P50709 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa11P50709 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa11P50709 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Defa11P50709 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Defa11P50709 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Defa11P50709 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Defa11P50709 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Defa11P50709 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa11P50709 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Defa11P50709 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Defa11P50709 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Defa11P50709 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa11P50709 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa11P50709 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Defa11P50709 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa11P50709 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa11P50709 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa11P50709 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa11P50709 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa11P50709 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa11P50709 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa11P50709 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa11P50709 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa11P50709 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa11P50709 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa11P50709 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa11P50709 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Defa11P50709 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa11P50709 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Defa11P50709 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa11P50709 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa11P50709 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa11P50709 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Defa11P50709 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa11P50709 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Defa11P50709 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Defa11P50709 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Defa11P50709 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Defa11P50709 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Defa11P50709 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Defa11P50709 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Defa11P50709 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Defa11P50709 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Defa11P50709 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Defa11P50709 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Defa11P50709 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa11P50709 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Defa11P50709 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Defa11P50709 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa11P50709 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Defa11P50709 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa11P50709 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Defa11P50709 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa11P50709 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa11P50709 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Defa11P50709 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Defa11P50709 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Defa11P50709 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa11P50709 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Defa11P50709 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Defa11P50709 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa11P50709 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa11P50709 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Defa11P50709 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms