Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa10P50708 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa10P50708 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa10P50708 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa10P50708 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa10P50708 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa10P50708 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa10P50708 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa10P50708 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa10P50708 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa10P50708 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa10P50708 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa10P50708 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa10P50708 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa10P50708 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa10P50708 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms