Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Defa10P50708 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Defa10P50708 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Defa10P50708 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa10P50708 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa10P50708 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa10P50708 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa10P50708 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa10P50708 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa10P50708 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Defa10P50708 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Defa10P50708 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa10P50708 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Defa10P50708 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa10P50708 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa10P50708 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa10P50708 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa10P50708 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa10P50708 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa10P50708 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa10P50708 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa10P50708 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Defa10P50708 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa10P50708 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa10P50708 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms