Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tac1P41539 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tac1P41539 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tac1P41539 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tac1P41539 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tac1P41539 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tac1P41539 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tac1P41539 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tac1P41539 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tac1P41539 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tac1P41539 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tac1P41539 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tac1P41539 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tac1P41539 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tac1P41539 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tac1P41539 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tac1P41539 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tac1P41539 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tac1P41539 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tac1P41539 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tac1P41539 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tac1P41539 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tac1P41539 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tac1P41539 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tac1P41539 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tac1P41539 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tac1P41539 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tac1P41539 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tac1P41539 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tac1P41539 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tac1P41539 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tac1P41539 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tac1P41539 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tac1P41539 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tac1P41539 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tac1P41539 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tac1P41539 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tac1P41539 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tac1P41539 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tac1P41539 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tac1P41539 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tac1P41539 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tac1P41539 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tac1P41539 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tac1P41539 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tac1P41539 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tac1P41539 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tac1P41539 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tac1P41539 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tac1P41539 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tac1P41539 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tac1P41539 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tac1P41539 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tac1P41539 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tac1P41539 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tac1P41539 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tac1P41539 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tac1P41539 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tac1P41539 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tac1P41539 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tac1P41539 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tac1P41539 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tac1P41539 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tac1P41539 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tac1P41539 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tac1P41539 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tac1P41539 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tac1P41539 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tac1P41539 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tac1P41539 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tac1P41539 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tac1P41539 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tac1P41539 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tac1P41539 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tac1P41539 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tac1P41539 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tac1P41539 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tac1P41539 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tac1P41539 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tac1P41539 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tac1P41539 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tac1P41539 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tac1P41539 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tac1P41539 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tac1P41539 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tac1P41539 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tac1P41539 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tac1P41539 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tac1P41539 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tac1P41539 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tac1P41539 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tac1P41539 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tac1P41539 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tac1P41539 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tac1P41539 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tac1P41539 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tac1P41539 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tac1P41539 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tac1P41539 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tac1P41539 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms