Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ddit3P35639 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ddit3P35639 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ddit3P35639 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ddit3P35639 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ddit3P35639 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ddit3P35639 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ddit3P35639 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ddit3P35639 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ddit3P35639 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ddit3P35639 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Ddit3P35639 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ddit3P35639 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ddit3P35639 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ddit3P35639 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ddit3P35639 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ddit3P35639 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ddit3P35639 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ddit3P35639 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ddit3P35639 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ddit3P35639 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ddit3P35639 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ddit3P35639 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ddit3P35639 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ddit3P35639 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ddit3P35639 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ddit3P35639 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ddit3P35639 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Ddit3P35639 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ddit3P35639 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ddit3P35639 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ddit3P35639 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ddit3P35639 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ddit3P35639 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ddit3P35639 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ddit3P35639 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Ddit3P35639 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Ddit3P35639 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ddit3P35639 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ddit3P35639 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ddit3P35639 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ddit3P35639 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ddit3P35639 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ddit3P35639 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ddit3P35639 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ddit3P35639 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ddit3P35639 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ddit3P35639 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ddit3P35639 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ddit3P35639 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ddit3P35639 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ddit3P35639 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ddit3P35639 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ddit3P35639 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ddit3P35639 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ddit3P35639 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ddit3P35639 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ddit3P35639 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ddit3P35639 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Ddit3P35639 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ddit3P35639 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ddit3P35639 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ddit3P35639 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ddit3P35639 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ddit3P35639 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ddit3P35639 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ddit3P35639 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ddit3P35639 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Ddit3P35639 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ddit3P35639 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Ddit3P35639 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Ddit3P35639 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Ddit3P35639 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Ddit3P35639 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ddit3P35639 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Ddit3P35639 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ddit3P35639 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Ddit3P35639 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ddit3P35639 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Ddit3P35639 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Ddit3P35639 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ddit3P35639 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ddit3P35639 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ddit3P35639 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ddit3P35639 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ddit3P35639 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ddit3P35639 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ddit3P35639 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ddit3P35639 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ddit3P35639 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms