Protein–RNA interactions for Protein: P31955

Areg, Amphiregulin, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AregP31955 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AregP31955 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AregP31955 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AregP31955 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AregP31955 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AregP31955 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AregP31955 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AregP31955 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AregP31955 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AregP31955 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AregP31955 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AregP31955 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AregP31955 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AregP31955 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
AregP31955 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AregP31955 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AregP31955 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AregP31955 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AregP31955 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AregP31955 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AregP31955 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AregP31955 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AregP31955 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AregP31955 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AregP31955 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AregP31955 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AregP31955 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AregP31955 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AregP31955 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AregP31955 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AregP31955 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AregP31955 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AregP31955 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AregP31955 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AregP31955 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AregP31955 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AregP31955 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AregP31955 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AregP31955 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AregP31955 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AregP31955 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AregP31955 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AregP31955 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AregP31955 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AregP31955 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AregP31955 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AregP31955 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AregP31955 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AregP31955 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AregP31955 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AregP31955 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AregP31955 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AregP31955 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
AregP31955 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AregP31955 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AregP31955 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AregP31955 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AregP31955 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AregP31955 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AregP31955 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AregP31955 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AregP31955 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AregP31955 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AregP31955 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AregP31955 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AregP31955 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
AregP31955 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AregP31955 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AregP31955 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AregP31955 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AregP31955 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AregP31955 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AregP31955 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AregP31955 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AregP31955 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AregP31955 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AregP31955 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AregP31955 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AregP31955 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AregP31955 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AregP31955 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AregP31955 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AregP31955 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AregP31955 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AregP31955 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AregP31955 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AregP31955 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AregP31955 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AregP31955 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AregP31955 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AregP31955 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AregP31955 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AregP31955 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AregP31955 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AregP31955 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AregP31955 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AregP31955 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AregP31955 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AregP31955 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AregP31955 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms