Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Saa4P31532 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Saa4P31532 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Saa4P31532 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Saa4P31532 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Saa4P31532 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Saa4P31532 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Saa4P31532 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Saa4P31532 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Saa4P31532 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Saa4P31532 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Saa4P31532 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Saa4P31532 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Saa4P31532 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Saa4P31532 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Saa4P31532 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Saa4P31532 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Saa4P31532 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Saa4P31532 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Saa4P31532 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Saa4P31532 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Saa4P31532 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Saa4P31532 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Saa4P31532 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Saa4P31532 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Saa4P31532 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Saa4P31532 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Saa4P31532 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Saa4P31532 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Saa4P31532 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Saa4P31532 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Saa4P31532 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Saa4P31532 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Saa4P31532 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Saa4P31532 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Saa4P31532 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Saa4P31532 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Saa4P31532 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Saa4P31532 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Saa4P31532 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Saa4P31532 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Saa4P31532 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Saa4P31532 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Saa4P31532 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Saa4P31532 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Saa4P31532 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Saa4P31532 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Saa4P31532 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Saa4P31532 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Saa4P31532 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Saa4P31532 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Saa4P31532 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Saa4P31532 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Saa4P31532 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Saa4P31532 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Saa4P31532 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Saa4P31532 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Saa4P31532 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Saa4P31532 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Saa4P31532 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Saa4P31532 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Saa4P31532 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Saa4P31532 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Saa4P31532 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Saa4P31532 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Saa4P31532 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Saa4P31532 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Saa4P31532 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Saa4P31532 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Saa4P31532 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Saa4P31532 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Saa4P31532 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Saa4P31532 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Saa4P31532 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Saa4P31532 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Saa4P31532 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Saa4P31532 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Saa4P31532 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Saa4P31532 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Saa4P31532 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Saa4P31532 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Saa4P31532 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Saa4P31532 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Saa4P31532 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Saa4P31532 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Saa4P31532 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Saa4P31532 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Saa4P31532 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Saa4P31532 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Saa4P31532 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms