Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gsx2P31316 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gsx2P31316 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gsx2P31316 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gsx2P31316 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gsx2P31316 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gsx2P31316 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gsx2P31316 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gsx2P31316 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gsx2P31316 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gsx2P31316 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gsx2P31316 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gsx2P31316 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gsx2P31316 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gsx2P31316 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gsx2P31316 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gsx2P31316 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gsx2P31316 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gsx2P31316 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gsx2P31316 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gsx2P31316 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gsx2P31316 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gsx2P31316 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gsx2P31316 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gsx2P31316 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gsx2P31316 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gsx2P31316 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gsx2P31316 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsx2P31316 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsx2P31316 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gsx2P31316 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gsx2P31316 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gsx2P31316 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gsx2P31316 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gsx2P31316 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gsx2P31316 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gsx2P31316 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gsx2P31316 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gsx2P31316 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gsx2P31316 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gsx2P31316 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gsx2P31316 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gsx2P31316 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gsx2P31316 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gsx2P31316 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gsx2P31316 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gsx2P31316 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gsx2P31316 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gsx2P31316 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gsx2P31316 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gsx2P31316 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gsx2P31316 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gsx2P31316 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gsx2P31316 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gsx2P31316 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gsx2P31316 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gsx2P31316 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gsx2P31316 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gsx2P31316 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gsx2P31316 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gsx2P31316 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gsx2P31316 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gsx2P31316 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gsx2P31316 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gsx2P31316 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gsx2P31316 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gsx2P31316 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gsx2P31316 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gsx2P31316 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gsx2P31316 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gsx2P31316 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gsx2P31316 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gsx2P31316 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gsx2P31316 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gsx2P31316 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gsx2P31316 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gsx2P31316 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gsx2P31316 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gsx2P31316 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gsx2P31316 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gsx2P31316 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gsx2P31316 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gsx2P31316 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gsx2P31316 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gsx2P31316 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gsx2P31316 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gsx2P31316 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gsx2P31316 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gsx2P31316 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gsx2P31316 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gsx2P31316 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gsx2P31316 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gsx2P31316 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gsx2P31316 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gsx2P31316 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gsx2P31316 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gsx2P31316 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gsx2P31316 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gsx2P31316 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gsx2P31316 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms