Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxd9P28357 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxd9P28357 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxd9P28357 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxd9P28357 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxd9P28357 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxd9P28357 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hoxd9P28357 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxd9P28357 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxd9P28357 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxd9P28357 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxd9P28357 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxd9P28357 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxd9P28357 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxd9P28357 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxd9P28357 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hoxd9P28357 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxd9P28357 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxd9P28357 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxd9P28357 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hoxd9P28357 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hoxd9P28357 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxd9P28357 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxd9P28357 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd9P28357 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxd9P28357 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxd9P28357 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxd9P28357 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxd9P28357 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxd9P28357 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxd9P28357 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd9P28357 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd9P28357 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxd9P28357 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxd9P28357 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxd9P28357 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hoxd9P28357 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxd9P28357 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxd9P28357 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxd9P28357 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxd9P28357 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9P28357 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hoxd9P28357 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxd9P28357 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxd9P28357 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxd9P28357 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxd9P28357 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hoxd9P28357 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxd9P28357 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxd9P28357 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxd9P28357 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd9P28357 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxd9P28357 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hoxd9P28357 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hoxd9P28357 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxd9P28357 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd9P28357 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd9P28357 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxd9P28357 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxd9P28357 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxd9P28357 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd9P28357 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxd9P28357 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxd9P28357 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxd9P28357 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxd9P28357 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxd9P28357 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxd9P28357 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxd9P28357 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd9P28357 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxd9P28357 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd9P28357 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd9P28357 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd9P28357 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd9P28357 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd9P28357 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd9P28357 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd9P28357 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd9P28357 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd9P28357 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd9P28357 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd9P28357 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd9P28357 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd9P28357 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd9P28357 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd9P28357 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd9P28357 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd9P28357 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd9P28357 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd9P28357 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxd9P28357 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd9P28357 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxd9P28357 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxd9P28357 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd9P28357 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd9P28357 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxd9P28357 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxd9P28357 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd9P28357 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxd9P28357 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms