Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CenpbP27790 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CenpbP27790 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CenpbP27790 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CenpbP27790 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CenpbP27790 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CenpbP27790 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CenpbP27790 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CenpbP27790 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CenpbP27790 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CenpbP27790 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CenpbP27790 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CenpbP27790 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CenpbP27790 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CenpbP27790 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CenpbP27790 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CenpbP27790 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CenpbP27790 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CenpbP27790 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
CenpbP27790 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CenpbP27790 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CenpbP27790 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CenpbP27790 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CenpbP27790 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
CenpbP27790 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CenpbP27790 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CenpbP27790 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CenpbP27790 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CenpbP27790 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CenpbP27790 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CenpbP27790 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
CenpbP27790 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CenpbP27790 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CenpbP27790 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CenpbP27790 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CenpbP27790 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CenpbP27790 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CenpbP27790 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CenpbP27790 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CenpbP27790 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CenpbP27790 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CenpbP27790 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CenpbP27790 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CenpbP27790 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CenpbP27790 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CenpbP27790 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CenpbP27790 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CenpbP27790 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CenpbP27790 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CenpbP27790 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CenpbP27790 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CenpbP27790 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CenpbP27790 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CenpbP27790 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CenpbP27790 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CenpbP27790 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CenpbP27790 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CenpbP27790 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CenpbP27790 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CenpbP27790 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
CenpbP27790 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CenpbP27790 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CenpbP27790 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CenpbP27790 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CenpbP27790 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CenpbP27790 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CenpbP27790 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CenpbP27790 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CenpbP27790 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CenpbP27790 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CenpbP27790 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CenpbP27790 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CenpbP27790 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CenpbP27790 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CenpbP27790 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CenpbP27790 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CenpbP27790 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CenpbP27790 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CenpbP27790 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CenpbP27790 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CenpbP27790 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CenpbP27790 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
CenpbP27790 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CenpbP27790 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CenpbP27790 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CenpbP27790 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CenpbP27790 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CenpbP27790 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CenpbP27790 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CenpbP27790 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CenpbP27790 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.9 ms