Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col8a2P25318 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col8a2P25318 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col8a2P25318 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col8a2P25318 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col8a2P25318 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col8a2P25318 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col8a2P25318 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col8a2P25318 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col8a2P25318 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col8a2P25318 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col8a2P25318 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col8a2P25318 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col8a2P25318 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col8a2P25318 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col8a2P25318 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col8a2P25318 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Col8a2P25318 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col8a2P25318 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col8a2P25318 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col8a2P25318 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col8a2P25318 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col8a2P25318 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col8a2P25318 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col8a2P25318 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col8a2P25318 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col8a2P25318 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col8a2P25318 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col8a2P25318 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col8a2P25318 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col8a2P25318 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col8a2P25318 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col8a2P25318 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col8a2P25318 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col8a2P25318 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col8a2P25318 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col8a2P25318 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col8a2P25318 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col8a2P25318 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col8a2P25318 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col8a2P25318 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col8a2P25318 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col8a2P25318 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col8a2P25318 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col8a2P25318 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col8a2P25318 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col8a2P25318 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col8a2P25318 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col8a2P25318 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col8a2P25318 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col8a2P25318 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col8a2P25318 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col8a2P25318 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col8a2P25318 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col8a2P25318 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col8a2P25318 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col8a2P25318 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col8a2P25318 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col8a2P25318 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col8a2P25318 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col8a2P25318 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col8a2P25318 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col8a2P25318 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col8a2P25318 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col8a2P25318 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col8a2P25318 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col8a2P25318 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col8a2P25318 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col8a2P25318 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col8a2P25318 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col8a2P25318 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col8a2P25318 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col8a2P25318 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col8a2P25318 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col8a2P25318 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col8a2P25318 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col8a2P25318 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col8a2P25318 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col8a2P25318 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col8a2P25318 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col8a2P25318 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col8a2P25318 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col8a2P25318 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col8a2P25318 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col8a2P25318 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col8a2P25318 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col8a2P25318 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col8a2P25318 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col8a2P25318 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col8a2P25318 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col8a2P25318 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col8a2P25318 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col8a2P25318 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col8a2P25318 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col8a2P25318 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col8a2P25318 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col8a2P25318 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col8a2P25318 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col8a2P25318 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col8a2P25318 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms