Protein–RNA interactions for Protein: P21995

Emb, Embigin, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmbP21995 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EmbP21995 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EmbP21995 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EmbP21995 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
EmbP21995 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EmbP21995 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EmbP21995 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EmbP21995 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EmbP21995 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EmbP21995 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EmbP21995 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EmbP21995 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EmbP21995 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EmbP21995 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EmbP21995 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EmbP21995 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EmbP21995 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EmbP21995 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
EmbP21995 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EmbP21995 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
EmbP21995 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EmbP21995 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EmbP21995 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EmbP21995 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EmbP21995 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EmbP21995 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EmbP21995 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EmbP21995 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EmbP21995 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
EmbP21995 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EmbP21995 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EmbP21995 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EmbP21995 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EmbP21995 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EmbP21995 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EmbP21995 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EmbP21995 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
EmbP21995 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EmbP21995 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EmbP21995 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EmbP21995 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EmbP21995 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EmbP21995 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EmbP21995 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EmbP21995 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EmbP21995 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EmbP21995 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EmbP21995 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EmbP21995 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EmbP21995 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
EmbP21995 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EmbP21995 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EmbP21995 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EmbP21995 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EmbP21995 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EmbP21995 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EmbP21995 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EmbP21995 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EmbP21995 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EmbP21995 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EmbP21995 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EmbP21995 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EmbP21995 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EmbP21995 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EmbP21995 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EmbP21995 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EmbP21995 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EmbP21995 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EmbP21995 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EmbP21995 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EmbP21995 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EmbP21995 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EmbP21995 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
EmbP21995 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
EmbP21995 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EmbP21995 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EmbP21995 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EmbP21995 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EmbP21995 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EmbP21995 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EmbP21995 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EmbP21995 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EmbP21995 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EmbP21995 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EmbP21995 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EmbP21995 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EmbP21995 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EmbP21995 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EmbP21995 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EmbP21995 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EmbP21995 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EmbP21995 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EmbP21995 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EmbP21995 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EmbP21995 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EmbP21995 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EmbP21995 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EmbP21995 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EmbP21995 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EmbP21995 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms