Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
P20040 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P20040 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P20040 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P20040 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
P20040 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P20040 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P20040 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P20040 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P20040 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P20040 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P20040 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P20040 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P20040 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P20040 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P20040 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P20040 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P20040 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
P20040 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
P20040 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
P20040 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
P20040 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P20040 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P20040 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P20040 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P20040 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P20040 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P20040 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P20040 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P20040 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
P20040 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P20040 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
P20040 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P20040 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P20040 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P20040 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P20040 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P20040 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P20040 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P20040 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P20040 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P20040 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P20040 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P20040 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
P20040 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P20040 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P20040 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P20040 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P20040 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P20040 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P20040 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P20040 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P20040 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P20040 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P20040 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P20040 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P20040 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P20040 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
P20040 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P20040 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
P20040 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
P20040 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
P20040 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
P20040 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
P20040 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P20040 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
P20040 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P20040 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
P20040 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P20040 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
P20040 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P20040 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P20040 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P20040 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P20040 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
P20040 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
P20040 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P20040 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
P20040 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P20040 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P20040 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
P20040 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P20040 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P20040 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
P20040 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P20040 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P20040 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P20040 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P20040 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P20040 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
P20040 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P20040 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P20040 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
P20040 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
P20040 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P20040 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P20040 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P20040 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P20040 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
P20040 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms