Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P18525 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P18525 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P18525 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P18525 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P18525 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
P18525 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P18525 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
P18525 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P18525 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
P18525 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P18525 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P18525 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P18525 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P18525 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P18525 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
P18525 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P18525 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P18525 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P18525 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P18525 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P18525 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P18525 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P18525 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P18525 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P18525 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P18525 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P18525 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P18525 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
P18525 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P18525 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P18525 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P18525 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P18525 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P18525 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P18525 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P18525 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P18525 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P18525 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
P18525 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P18525 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P18525 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
P18525 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P18525 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
P18525 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P18525 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
P18525 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P18525 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P18525 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P18525 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P18525 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P18525 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P18525 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P18525 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P18525 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P18525 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P18525 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P18525 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P18525 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P18525 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P18525 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P18525 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P18525 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P18525 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P18525 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P18525 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P18525 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P18525 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P18525 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P18525 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P18525 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P18525 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P18525 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P18525 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P18525 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P18525 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P18525 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P18525 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P18525 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P18525 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P18525 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P18525 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18525 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18525 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P18525 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P18525 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P18525 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P18525 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P18525 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P18525 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P18525 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P18525 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P18525 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P18525 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P18525 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P18525 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P18525 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P18525 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P18525 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P18525 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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