Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgfb3P17125 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgfb3P17125 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tgfb3P17125 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tgfb3P17125 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tgfb3P17125 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tgfb3P17125 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tgfb3P17125 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tgfb3P17125 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tgfb3P17125 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tgfb3P17125 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tgfb3P17125 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tgfb3P17125 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tgfb3P17125 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tgfb3P17125 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tgfb3P17125 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tgfb3P17125 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgfb3P17125 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tgfb3P17125 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tgfb3P17125 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tgfb3P17125 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgfb3P17125 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tgfb3P17125 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tgfb3P17125 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tgfb3P17125 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tgfb3P17125 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tgfb3P17125 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tgfb3P17125 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tgfb3P17125 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tgfb3P17125 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tgfb3P17125 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tgfb3P17125 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tgfb3P17125 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tgfb3P17125 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tgfb3P17125 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tgfb3P17125 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tgfb3P17125 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tgfb3P17125 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tgfb3P17125 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tgfb3P17125 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tgfb3P17125 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tgfb3P17125 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tgfb3P17125 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tgfb3P17125 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tgfb3P17125 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tgfb3P17125 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tgfb3P17125 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tgfb3P17125 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Tgfb3P17125 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tgfb3P17125 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tgfb3P17125 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tgfb3P17125 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tgfb3P17125 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tgfb3P17125 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tgfb3P17125 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tgfb3P17125 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tgfb3P17125 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tgfb3P17125 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tgfb3P17125 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgfb3P17125 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgfb3P17125 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tgfb3P17125 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tgfb3P17125 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tgfb3P17125 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tgfb3P17125 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tgfb3P17125 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tgfb3P17125 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tgfb3P17125 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tgfb3P17125 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tgfb3P17125 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tgfb3P17125 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tgfb3P17125 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgfb3P17125 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tgfb3P17125 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tgfb3P17125 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tgfb3P17125 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tgfb3P17125 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tgfb3P17125 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Tgfb3P17125 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tgfb3P17125 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tgfb3P17125 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tgfb3P17125 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tgfb3P17125 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tgfb3P17125 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tgfb3P17125 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tgfb3P17125 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tgfb3P17125 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tgfb3P17125 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tgfb3P17125 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tgfb3P17125 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb3P17125 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb3P17125 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tgfb3P17125 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tgfb3P17125 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tgfb3P17125 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tgfb3P17125 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tgfb3P17125 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tgfb3P17125 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tgfb3P17125 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tgfb3P17125 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms