Protein–RNA interactions for Protein: P15806

Tcf3, Transcription factor E2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf3P15806 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tcf3P15806 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tcf3P15806 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tcf3P15806 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tcf3P15806 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Tcf3P15806 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tcf3P15806 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Tcf3P15806 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tcf3P15806 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tcf3P15806 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tcf3P15806 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tcf3P15806 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tcf3P15806 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tcf3P15806 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Tcf3P15806 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Tcf3P15806 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tcf3P15806 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Tcf3P15806 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tcf3P15806 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tcf3P15806 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tcf3P15806 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tcf3P15806 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tcf3P15806 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tcf3P15806 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tcf3P15806 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tcf3P15806 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tcf3P15806 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tcf3P15806 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tcf3P15806 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tcf3P15806 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tcf3P15806 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tcf3P15806 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tcf3P15806 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tcf3P15806 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tcf3P15806 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Tcf3P15806 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcf3P15806 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcf3P15806 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tcf3P15806 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tcf3P15806 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tcf3P15806 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcf3P15806 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcf3P15806 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tcf3P15806 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tcf3P15806 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tcf3P15806 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tcf3P15806 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tcf3P15806 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tcf3P15806 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tcf3P15806 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcf3P15806 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcf3P15806 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tcf3P15806 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tcf3P15806 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tcf3P15806 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcf3P15806 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tcf3P15806 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tcf3P15806 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tcf3P15806 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tcf3P15806 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tcf3P15806 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tcf3P15806 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tcf3P15806 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tcf3P15806 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tcf3P15806 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tcf3P15806 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tcf3P15806 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcf3P15806 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcf3P15806 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcf3P15806 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tcf3P15806 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tcf3P15806 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tcf3P15806 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tcf3P15806 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tcf3P15806 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tcf3P15806 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tcf3P15806 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcf3P15806 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tcf3P15806 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tcf3P15806 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcf3P15806 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tcf3P15806 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tcf3P15806 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcf3P15806 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcf3P15806 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcf3P15806 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcf3P15806 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tcf3P15806 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcf3P15806 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tcf3P15806 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tcf3P15806 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Tcf3P15806 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tcf3P15806 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tcf3P15806 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tcf3P15806 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tcf3P15806 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tcf3P15806 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcf3P15806 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcf3P15806 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tcf3P15806 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms