Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RhoP15409 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RhoP15409 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RhoP15409 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RhoP15409 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RhoP15409 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RhoP15409 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RhoP15409 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RhoP15409 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RhoP15409 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RhoP15409 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RhoP15409 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RhoP15409 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RhoP15409 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RhoP15409 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RhoP15409 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RhoP15409 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RhoP15409 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RhoP15409 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RhoP15409 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RhoP15409 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RhoP15409 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RhoP15409 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RhoP15409 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RhoP15409 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RhoP15409 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RhoP15409 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RhoP15409 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RhoP15409 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RhoP15409 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RhoP15409 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RhoP15409 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RhoP15409 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RhoP15409 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RhoP15409 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RhoP15409 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RhoP15409 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RhoP15409 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RhoP15409 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RhoP15409 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RhoP15409 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RhoP15409 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RhoP15409 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RhoP15409 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RhoP15409 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RhoP15409 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RhoP15409 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RhoP15409 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RhoP15409 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RhoP15409 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RhoP15409 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RhoP15409 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RhoP15409 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RhoP15409 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RhoP15409 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RhoP15409 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RhoP15409 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RhoP15409 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RhoP15409 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RhoP15409 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RhoP15409 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RhoP15409 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RhoP15409 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RhoP15409 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RhoP15409 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RhoP15409 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RhoP15409 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RhoP15409 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RhoP15409 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RhoP15409 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RhoP15409 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RhoP15409 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RhoP15409 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RhoP15409 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RhoP15409 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RhoP15409 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RhoP15409 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RhoP15409 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RhoP15409 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RhoP15409 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RhoP15409 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RhoP15409 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RhoP15409 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RhoP15409 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RhoP15409 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RhoP15409 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RhoP15409 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RhoP15409 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RhoP15409 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RhoP15409 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RhoP15409 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RhoP15409 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RhoP15409 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RhoP15409 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RhoP15409 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RhoP15409 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RhoP15409 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RhoP15409 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RhoP15409 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RhoP15409 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms