Protein–RNA interactions for Protein: P15089

Cpa3, Mast cell carboxypeptidase A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa3P15089 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpa3P15089 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpa3P15089 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpa3P15089 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpa3P15089 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cpa3P15089 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpa3P15089 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cpa3P15089 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cpa3P15089 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cpa3P15089 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpa3P15089 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cpa3P15089 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpa3P15089 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cpa3P15089 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cpa3P15089 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cpa3P15089 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cpa3P15089 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cpa3P15089 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cpa3P15089 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpa3P15089 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cpa3P15089 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cpa3P15089 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cpa3P15089 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cpa3P15089 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpa3P15089 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cpa3P15089 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cpa3P15089 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cpa3P15089 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cpa3P15089 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpa3P15089 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cpa3P15089 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpa3P15089 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpa3P15089 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpa3P15089 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpa3P15089 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpa3P15089 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpa3P15089 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpa3P15089 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpa3P15089 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpa3P15089 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpa3P15089 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpa3P15089 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpa3P15089 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpa3P15089 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cpa3P15089 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cpa3P15089 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpa3P15089 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cpa3P15089 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpa3P15089 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpa3P15089 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpa3P15089 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpa3P15089 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpa3P15089 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpa3P15089 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cpa3P15089 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpa3P15089 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpa3P15089 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cpa3P15089 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpa3P15089 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpa3P15089 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpa3P15089 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cpa3P15089 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpa3P15089 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpa3P15089 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpa3P15089 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cpa3P15089 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpa3P15089 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpa3P15089 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpa3P15089 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cpa3P15089 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cpa3P15089 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpa3P15089 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cpa3P15089 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpa3P15089 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cpa3P15089 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cpa3P15089 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cpa3P15089 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cpa3P15089 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cpa3P15089 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpa3P15089 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpa3P15089 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpa3P15089 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cpa3P15089 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpa3P15089 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpa3P15089 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpa3P15089 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpa3P15089 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpa3P15089 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpa3P15089 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cpa3P15089 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cpa3P15089 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms