Protein–RNA interactions for Protein: P11033

Gzmd, Granzyme D, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmdP11033 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GzmdP11033 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GzmdP11033 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GzmdP11033 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GzmdP11033 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GzmdP11033 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GzmdP11033 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GzmdP11033 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GzmdP11033 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GzmdP11033 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GzmdP11033 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GzmdP11033 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GzmdP11033 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GzmdP11033 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GzmdP11033 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GzmdP11033 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GzmdP11033 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GzmdP11033 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GzmdP11033 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GzmdP11033 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GzmdP11033 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GzmdP11033 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GzmdP11033 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GzmdP11033 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GzmdP11033 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GzmdP11033 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GzmdP11033 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GzmdP11033 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GzmdP11033 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GzmdP11033 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GzmdP11033 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GzmdP11033 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GzmdP11033 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GzmdP11033 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GzmdP11033 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GzmdP11033 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GzmdP11033 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GzmdP11033 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GzmdP11033 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GzmdP11033 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GzmdP11033 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GzmdP11033 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GzmdP11033 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GzmdP11033 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GzmdP11033 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GzmdP11033 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GzmdP11033 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GzmdP11033 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GzmdP11033 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GzmdP11033 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GzmdP11033 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GzmdP11033 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GzmdP11033 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GzmdP11033 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GzmdP11033 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GzmdP11033 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GzmdP11033 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GzmdP11033 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GzmdP11033 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GzmdP11033 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GzmdP11033 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GzmdP11033 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GzmdP11033 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GzmdP11033 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GzmdP11033 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GzmdP11033 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GzmdP11033 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GzmdP11033 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GzmdP11033 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GzmdP11033 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GzmdP11033 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GzmdP11033 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GzmdP11033 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GzmdP11033 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GzmdP11033 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GzmdP11033 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GzmdP11033 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GzmdP11033 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GzmdP11033 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GzmdP11033 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GzmdP11033 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GzmdP11033 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GzmdP11033 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GzmdP11033 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GzmdP11033 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GzmdP11033 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GzmdP11033 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GzmdP11033 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GzmdP11033 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GzmdP11033 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GzmdP11033 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms