Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcea1P10711 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcea1P10711 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcea1P10711 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcea1P10711 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcea1P10711 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tcea1P10711 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcea1P10711 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcea1P10711 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcea1P10711 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcea1P10711 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcea1P10711 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tcea1P10711 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcea1P10711 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcea1P10711 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcea1P10711 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcea1P10711 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcea1P10711 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcea1P10711 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcea1P10711 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcea1P10711 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcea1P10711 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcea1P10711 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcea1P10711 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcea1P10711 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcea1P10711 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcea1P10711 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tcea1P10711 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcea1P10711 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcea1P10711 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcea1P10711 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcea1P10711 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcea1P10711 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcea1P10711 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcea1P10711 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcea1P10711 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcea1P10711 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcea1P10711 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcea1P10711 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcea1P10711 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcea1P10711 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcea1P10711 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcea1P10711 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcea1P10711 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcea1P10711 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcea1P10711 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcea1P10711 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcea1P10711 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcea1P10711 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcea1P10711 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcea1P10711 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcea1P10711 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcea1P10711 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcea1P10711 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcea1P10711 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcea1P10711 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcea1P10711 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcea1P10711 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcea1P10711 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcea1P10711 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcea1P10711 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcea1P10711 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcea1P10711 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcea1P10711 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcea1P10711 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcea1P10711 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcea1P10711 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcea1P10711 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcea1P10711 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcea1P10711 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcea1P10711 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcea1P10711 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcea1P10711 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcea1P10711 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcea1P10711 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcea1P10711 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcea1P10711 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcea1P10711 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcea1P10711 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcea1P10711 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcea1P10711 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcea1P10711 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcea1P10711 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcea1P10711 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcea1P10711 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcea1P10711 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcea1P10711 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcea1P10711 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcea1P10711 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcea1P10711 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcea1P10711 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcea1P10711 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcea1P10711 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcea1P10711 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcea1P10711 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcea1P10711 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcea1P10711 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tcea1P10711 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcea1P10711 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcea1P10711 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms