Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxb4P10284 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hoxb4P10284 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxb4P10284 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxb4P10284 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxb4P10284 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxb4P10284 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hoxb4P10284 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb4P10284 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb4P10284 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb4P10284 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb4P10284 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb4P10284 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxb4P10284 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb4P10284 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb4P10284 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hoxb4P10284 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hoxb4P10284 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxb4P10284 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hoxb4P10284 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxb4P10284 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxb4P10284 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxb4P10284 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxb4P10284 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxb4P10284 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxb4P10284 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxb4P10284 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxb4P10284 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxb4P10284 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxb4P10284 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxb4P10284 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hoxb4P10284 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hoxb4P10284 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hoxb4P10284 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Hoxb4P10284 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hoxb4P10284 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb4P10284 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hoxb4P10284 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb4P10284 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hoxb4P10284 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hoxb4P10284 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hoxb4P10284 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb4P10284 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hoxb4P10284 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb4P10284 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hoxb4P10284 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb4P10284 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hoxb4P10284 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Hoxb4P10284 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb4P10284 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hoxb4P10284 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb4P10284 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb4P10284 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb4P10284 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb4P10284 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb4P10284 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxb4P10284 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxb4P10284 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxb4P10284 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxb4P10284 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxb4P10284 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxb4P10284 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb4P10284 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb4P10284 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb4P10284 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb4P10284 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb4P10284 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb4P10284 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb4P10284 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb4P10284 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb4P10284 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb4P10284 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb4P10284 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb4P10284 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxb4P10284 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb4P10284 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxb4P10284 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxb4P10284 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxb4P10284 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxb4P10284 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxb4P10284 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxb4P10284 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxb4P10284 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxb4P10284 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxb4P10284 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxb4P10284 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxb4P10284 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxb4P10284 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb4P10284 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb4P10284 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms