Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01896 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01896 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01896 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01896 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01896 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
P01896 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01896 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01896 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01896 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01896 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
P01896 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01896 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P01896 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P01896 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01896 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P01896 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P01896 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
P01896 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P01896 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P01896 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
P01896 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
P01896 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
P01896 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P01896 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
P01896 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01896 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01896 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01896 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01896 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01896 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01896 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01896 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
P01896 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
P01896 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01896 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01896 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01896 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01896 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01896 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01896 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01896 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01896 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01896 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01896 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01896 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01896 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01896 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01896 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
P01896 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P01896 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
P01896 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01896 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01896 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01896 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01896 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P01896 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01896 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01896 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01896 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01896 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01896 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01896 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01896 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01896 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01896 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01896 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P01896 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01896 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01896 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01896 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01896 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01896 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01896 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01896 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01896 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01896 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01896 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01896 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01896 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01896 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01896 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01896 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01896 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P01896 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01896 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P01896 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P01896 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P01896 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P01896 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P01896 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01896 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01896 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01896 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01896 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01896 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01896 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01896 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01896 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01896 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms