Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Igk-V19-17P01633 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Igk-V19-17P01633 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Igk-V19-17P01633 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Igk-V19-17P01633 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Igk-V19-17P01633 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Igk-V19-17P01633 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Igk-V19-17P01633 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Igk-V19-17P01633 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Igk-V19-17P01633 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igk-V19-17P01633 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Igk-V19-17P01633 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Igk-V19-17P01633 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igk-V19-17P01633 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Igk-V19-17P01633 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Igk-V19-17P01633 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Igk-V19-17P01633 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Igk-V19-17P01633 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Igk-V19-17P01633 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Igk-V19-17P01633 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Igk-V19-17P01633 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Igk-V19-17P01633 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Igk-V19-17P01633 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Igk-V19-17P01633 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Igk-V19-17P01633 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Igk-V19-17P01633 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igk-V19-17P01633 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Igk-V19-17P01633 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Igk-V19-17P01633 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Igk-V19-17P01633 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Igk-V19-17P01633 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Igk-V19-17P01633 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igk-V19-17P01633 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Igk-V19-17P01633 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Igk-V19-17P01633 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Igk-V19-17P01633 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Igk-V19-17P01633 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Igk-V19-17P01633 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Igk-V19-17P01633 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Igk-V19-17P01633 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Igk-V19-17P01633 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igk-V19-17P01633 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igk-V19-17P01633 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igk-V19-17P01633 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Igk-V19-17P01633 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Igk-V19-17P01633 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Igk-V19-17P01633 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Igk-V19-17P01633 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Igk-V19-17P01633 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Igk-V19-17P01633 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Igk-V19-17P01633 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Igk-V19-17P01633 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Igk-V19-17P01633 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Igk-V19-17P01633 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Igk-V19-17P01633 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Igk-V19-17P01633 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Igk-V19-17P01633 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Igk-V19-17P01633 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Igk-V19-17P01633 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Igk-V19-17P01633 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Igk-V19-17P01633 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Igk-V19-17P01633 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Igk-V19-17P01633 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Igk-V19-17P01633 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Igk-V19-17P01633 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Igk-V19-17P01633 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Igk-V19-17P01633 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Igk-V19-17P01633 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igk-V19-17P01633 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Igk-V19-17P01633 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Igk-V19-17P01633 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igk-V19-17P01633 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igk-V19-17P01633 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Igk-V19-17P01633 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Igk-V19-17P01633 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Igk-V19-17P01633 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Igk-V19-17P01633 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Igk-V19-17P01633 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Igk-V19-17P01633 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Igk-V19-17P01633 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Igk-V19-17P01633 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igk-V19-17P01633 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Igk-V19-17P01633 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Igk-V19-17P01633 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Igk-V19-17P01633 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igk-V19-17P01633 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Igk-V19-17P01633 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Igk-V19-17P01633 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igk-V19-17P01633 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igk-V19-17P01633 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igk-V19-17P01633 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms