Protein–RNA interactions for Protein: O88531

Ppt1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt1O88531 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppt1O88531 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppt1O88531 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppt1O88531 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppt1O88531 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppt1O88531 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppt1O88531 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppt1O88531 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppt1O88531 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppt1O88531 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppt1O88531 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppt1O88531 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppt1O88531 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppt1O88531 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppt1O88531 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppt1O88531 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppt1O88531 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppt1O88531 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppt1O88531 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppt1O88531 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ppt1O88531 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ppt1O88531 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ppt1O88531 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ppt1O88531 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppt1O88531 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ppt1O88531 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ppt1O88531 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ppt1O88531 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ppt1O88531 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppt1O88531 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ppt1O88531 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ppt1O88531 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ppt1O88531 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ppt1O88531 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppt1O88531 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppt1O88531 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppt1O88531 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppt1O88531 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppt1O88531 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppt1O88531 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppt1O88531 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppt1O88531 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ppt1O88531 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ppt1O88531 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppt1O88531 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppt1O88531 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppt1O88531 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppt1O88531 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppt1O88531 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppt1O88531 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppt1O88531 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppt1O88531 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppt1O88531 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppt1O88531 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppt1O88531 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppt1O88531 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppt1O88531 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppt1O88531 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppt1O88531 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppt1O88531 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppt1O88531 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppt1O88531 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppt1O88531 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppt1O88531 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppt1O88531 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppt1O88531 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppt1O88531 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppt1O88531 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppt1O88531 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppt1O88531 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppt1O88531 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppt1O88531 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppt1O88531 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppt1O88531 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppt1O88531 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppt1O88531 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppt1O88531 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppt1O88531 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppt1O88531 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppt1O88531 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppt1O88531 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt1O88531 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt1O88531 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppt1O88531 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppt1O88531 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ppt1O88531 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt1O88531 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ppt1O88531 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ppt1O88531 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ppt1O88531 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms