Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Dll3O88516 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Dll3O88516 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Dll3O88516 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Dll3O88516 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Dll3O88516 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Dll3O88516 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Dll3O88516 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Dll3O88516 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dll3O88516 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Dll3O88516 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Dll3O88516 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Dll3O88516 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Dll3O88516 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dll3O88516 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dll3O88516 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Dll3O88516 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Dll3O88516 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dll3O88516 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Dll3O88516 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Dll3O88516 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Dll3O88516 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Dll3O88516 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Dll3O88516 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dll3O88516 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dll3O88516 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dll3O88516 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dll3O88516 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dll3O88516 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dll3O88516 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dll3O88516 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dll3O88516 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dll3O88516 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dll3O88516 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dll3O88516 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Dll3O88516 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dll3O88516 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Dll3O88516 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dll3O88516 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dll3O88516 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dll3O88516 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dll3O88516 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dll3O88516 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dll3O88516 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dll3O88516 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dll3O88516 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dll3O88516 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dll3O88516 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dll3O88516 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dll3O88516 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dll3O88516 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dll3O88516 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dll3O88516 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dll3O88516 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dll3O88516 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dll3O88516 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dll3O88516 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dll3O88516 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dll3O88516 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dll3O88516 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dll3O88516 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dll3O88516 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dll3O88516 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dll3O88516 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dll3O88516 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dll3O88516 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dll3O88516 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dll3O88516 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dll3O88516 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dll3O88516 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Dll3O88516 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dll3O88516 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dll3O88516 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Dll3O88516 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dll3O88516 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dll3O88516 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Dll3O88516 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dll3O88516 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dll3O88516 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Dll3O88516 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dll3O88516 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dll3O88516 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dll3O88516 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dll3O88516 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dll3O88516 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Dll3O88516 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Dll3O88516 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dll3O88516 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dll3O88516 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dll3O88516 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Dll3O88516 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dll3O88516 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dll3O88516 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dll3O88516 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dll3O88516 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Dll3O88516 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dll3O88516 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dll3O88516 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dll3O88516 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Dll3O88516 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms