Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CaskO70589 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CaskO70589 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CaskO70589 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CaskO70589 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CaskO70589 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CaskO70589 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CaskO70589 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CaskO70589 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CaskO70589 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CaskO70589 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CaskO70589 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CaskO70589 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CaskO70589 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CaskO70589 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CaskO70589 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CaskO70589 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CaskO70589 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CaskO70589 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CaskO70589 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CaskO70589 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CaskO70589 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CaskO70589 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CaskO70589 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CaskO70589 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CaskO70589 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CaskO70589 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CaskO70589 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CaskO70589 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CaskO70589 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CaskO70589 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CaskO70589 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CaskO70589 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CaskO70589 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CaskO70589 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CaskO70589 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CaskO70589 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CaskO70589 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CaskO70589 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CaskO70589 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CaskO70589 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CaskO70589 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CaskO70589 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CaskO70589 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CaskO70589 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CaskO70589 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CaskO70589 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CaskO70589 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CaskO70589 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CaskO70589 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CaskO70589 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CaskO70589 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CaskO70589 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CaskO70589 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CaskO70589 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CaskO70589 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CaskO70589 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CaskO70589 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CaskO70589 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CaskO70589 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CaskO70589 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CaskO70589 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CaskO70589 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CaskO70589 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CaskO70589 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CaskO70589 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CaskO70589 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CaskO70589 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CaskO70589 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CaskO70589 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CaskO70589 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CaskO70589 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CaskO70589 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CaskO70589 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CaskO70589 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CaskO70589 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CaskO70589 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CaskO70589 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CaskO70589 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CaskO70589 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CaskO70589 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CaskO70589 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CaskO70589 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CaskO70589 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CaskO70589 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CaskO70589 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CaskO70589 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CaskO70589 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CaskO70589 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CaskO70589 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CaskO70589 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CaskO70589 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CaskO70589 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CaskO70589 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CaskO70589 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CaskO70589 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CaskO70589 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CaskO70589 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CaskO70589 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CaskO70589 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms