Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Snx12O70493 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Snx12O70493 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Snx12O70493 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Snx12O70493 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snx12O70493 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snx12O70493 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snx12O70493 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snx12O70493 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Snx12O70493 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snx12O70493 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Snx12O70493 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snx12O70493 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Snx12O70493 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snx12O70493 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Snx12O70493 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snx12O70493 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snx12O70493 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Snx12O70493 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snx12O70493 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snx12O70493 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Snx12O70493 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snx12O70493 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Snx12O70493 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx12O70493 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snx12O70493 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Snx12O70493 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx12O70493 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx12O70493 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Snx12O70493 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Snx12O70493 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx12O70493 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx12O70493 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snx12O70493 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snx12O70493 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx12O70493 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx12O70493 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snx12O70493 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snx12O70493 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snx12O70493 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Snx12O70493 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Snx12O70493 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Snx12O70493 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx12O70493 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx12O70493 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx12O70493 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx12O70493 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx12O70493 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snx12O70493 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx12O70493 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx12O70493 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Snx12O70493 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx12O70493 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Snx12O70493 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snx12O70493 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Snx12O70493 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx12O70493 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx12O70493 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Snx12O70493 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx12O70493 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx12O70493 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx12O70493 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Snx12O70493 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snx12O70493 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snx12O70493 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snx12O70493 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx12O70493 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx12O70493 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snx12O70493 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Snx12O70493 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Snx12O70493 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Snx12O70493 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Snx12O70493 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Snx12O70493 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Snx12O70493 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snx12O70493 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Snx12O70493 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Snx12O70493 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Snx12O70493 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx12O70493 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Snx12O70493 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Snx12O70493 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Snx12O70493 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Snx12O70493 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Snx12O70493 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx12O70493 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Snx12O70493 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Snx12O70493 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Snx12O70493 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Snx12O70493 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx12O70493 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Snx12O70493 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Snx12O70493 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx12O70493 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Snx12O70493 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Snx12O70493 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Snx12O70493 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Snx12O70493 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx12O70493 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Snx12O70493 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms