Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp8O70404 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Vamp8O70404 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Vamp8O70404 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vamp8O70404 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Vamp8O70404 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vamp8O70404 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vamp8O70404 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vamp8O70404 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vamp8O70404 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vamp8O70404 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vamp8O70404 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp8O70404 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp8O70404 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp8O70404 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp8O70404 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp8O70404 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp8O70404 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp8O70404 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp8O70404 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp8O70404 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp8O70404 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp8O70404 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vamp8O70404 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp8O70404 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp8O70404 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp8O70404 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vamp8O70404 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vamp8O70404 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vamp8O70404 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Vamp8O70404 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vamp8O70404 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vamp8O70404 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp8O70404 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vamp8O70404 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vamp8O70404 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp8O70404 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vamp8O70404 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp8O70404 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vamp8O70404 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp8O70404 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp8O70404 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vamp8O70404 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp8O70404 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vamp8O70404 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vamp8O70404 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vamp8O70404 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp8O70404 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vamp8O70404 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp8O70404 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vamp8O70404 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vamp8O70404 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vamp8O70404 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp8O70404 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp8O70404 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp8O70404 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vamp8O70404 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp8O70404 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms