Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Atf5O70191 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Atf5O70191 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Atf5O70191 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Atf5O70191 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Atf5O70191 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Atf5O70191 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Atf5O70191 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Atf5O70191 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Atf5O70191 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Atf5O70191 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Atf5O70191 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Atf5O70191 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Atf5O70191 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Atf5O70191 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Atf5O70191 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Atf5O70191 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Atf5O70191 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Atf5O70191 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Atf5O70191 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Atf5O70191 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Atf5O70191 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Atf5O70191 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Atf5O70191 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Atf5O70191 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Atf5O70191 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Atf5O70191 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Atf5O70191 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Atf5O70191 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Atf5O70191 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Atf5O70191 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Atf5O70191 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Atf5O70191 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Atf5O70191 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Atf5O70191 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Atf5O70191 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Atf5O70191 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Atf5O70191 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Atf5O70191 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Atf5O70191 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Atf5O70191 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Atf5O70191 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Atf5O70191 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Atf5O70191 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Atf5O70191 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Atf5O70191 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Atf5O70191 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Atf5O70191 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Atf5O70191 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Atf5O70191 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Atf5O70191 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Atf5O70191 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Atf5O70191 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Atf5O70191 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Atf5O70191 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Atf5O70191 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Atf5O70191 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Atf5O70191 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Atf5O70191 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Atf5O70191 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Atf5O70191 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Atf5O70191 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Atf5O70191 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Atf5O70191 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Atf5O70191 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Atf5O70191 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atf5O70191 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Atf5O70191 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Atf5O70191 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Atf5O70191 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Atf5O70191 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atf5O70191 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Atf5O70191 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Atf5O70191 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Atf5O70191 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Atf5O70191 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Atf5O70191 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Atf5O70191 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atf5O70191 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atf5O70191 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atf5O70191 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Atf5O70191 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Atf5O70191 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Atf5O70191 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atf5O70191 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atf5O70191 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atf5O70191 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Atf5O70191 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Atf5O70191 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Atf5O70191 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Atf5O70191 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Atf5O70191 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Atf5O70191 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Atf5O70191 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Atf5O70191 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atf5O70191 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atf5O70191 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Atf5O70191 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atf5O70191 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atf5O70191 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms