Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cd70O55237 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cd70O55237 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Cd70O55237 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cd70O55237 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cd70O55237 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cd70O55237 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cd70O55237 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cd70O55237 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cd70O55237 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cd70O55237 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cd70O55237 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cd70O55237 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cd70O55237 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Cd70O55237 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cd70O55237 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cd70O55237 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Cd70O55237 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cd70O55237 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Cd70O55237 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Cd70O55237 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Cd70O55237 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Cd70O55237 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Cd70O55237 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Cd70O55237 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Cd70O55237 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cd70O55237 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Cd70O55237 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Cd70O55237 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cd70O55237 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cd70O55237 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cd70O55237 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cd70O55237 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cd70O55237 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Cd70O55237 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cd70O55237 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cd70O55237 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cd70O55237 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cd70O55237 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cd70O55237 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cd70O55237 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cd70O55237 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cd70O55237 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cd70O55237 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cd70O55237 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cd70O55237 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cd70O55237 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cd70O55237 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Cd70O55237 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cd70O55237 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cd70O55237 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cd70O55237 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cd70O55237 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cd70O55237 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cd70O55237 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cd70O55237 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Cd70O55237 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cd70O55237 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cd70O55237 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cd70O55237 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cd70O55237 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cd70O55237 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cd70O55237 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cd70O55237 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cd70O55237 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cd70O55237 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cd70O55237 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cd70O55237 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cd70O55237 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cd70O55237 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cd70O55237 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cd70O55237 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cd70O55237 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cd70O55237 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cd70O55237 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cd70O55237 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cd70O55237 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cd70O55237 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cd70O55237 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Cd70O55237 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cd70O55237 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cd70O55237 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cd70O55237 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cd70O55237 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cd70O55237 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cd70O55237 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cd70O55237 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cd70O55237 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cd70O55237 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cd70O55237 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cd70O55237 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cd70O55237 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cd70O55237 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cd70O55237 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cd70O55237 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cd70O55237 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cd70O55237 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cd70O55237 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cd70O55237 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cd70O55237 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms