Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BckdkO55028 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BckdkO55028 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BckdkO55028 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BckdkO55028 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BckdkO55028 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BckdkO55028 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BckdkO55028 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BckdkO55028 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BckdkO55028 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BckdkO55028 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BckdkO55028 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BckdkO55028 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BckdkO55028 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BckdkO55028 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BckdkO55028 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BckdkO55028 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BckdkO55028 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BckdkO55028 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BckdkO55028 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BckdkO55028 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BckdkO55028 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BckdkO55028 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BckdkO55028 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BckdkO55028 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BckdkO55028 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BckdkO55028 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BckdkO55028 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BckdkO55028 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BckdkO55028 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BckdkO55028 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BckdkO55028 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BckdkO55028 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BckdkO55028 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BckdkO55028 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BckdkO55028 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BckdkO55028 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BckdkO55028 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BckdkO55028 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BckdkO55028 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BckdkO55028 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BckdkO55028 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BckdkO55028 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BckdkO55028 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BckdkO55028 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BckdkO55028 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BckdkO55028 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BckdkO55028 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BckdkO55028 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BckdkO55028 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BckdkO55028 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BckdkO55028 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BckdkO55028 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BckdkO55028 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BckdkO55028 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BckdkO55028 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BckdkO55028 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BckdkO55028 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BckdkO55028 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BckdkO55028 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BckdkO55028 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BckdkO55028 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BckdkO55028 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BckdkO55028 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BckdkO55028 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BckdkO55028 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
BckdkO55028 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BckdkO55028 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BckdkO55028 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BckdkO55028 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BckdkO55028 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BckdkO55028 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BckdkO55028 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BckdkO55028 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BckdkO55028 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BckdkO55028 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BckdkO55028 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BckdkO55028 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BckdkO55028 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BckdkO55028 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BckdkO55028 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BckdkO55028 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BckdkO55028 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BckdkO55028 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BckdkO55028 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BckdkO55028 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BckdkO55028 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BckdkO55028 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BckdkO55028 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BckdkO55028 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BckdkO55028 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BckdkO55028 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BckdkO55028 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BckdkO55028 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BckdkO55028 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BckdkO55028 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BckdkO55028 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BckdkO55028 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BckdkO55028 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BckdkO55028 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms