Protein–RNA interactions for Protein: O54824

Il16, Pro-interleukin-16, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il16O54824 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Il16O54824 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Il16O54824 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Il16O54824 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
Il16O54824 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Il16O54824 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Il16O54824 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Il16O54824 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Il16O54824 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Il16O54824 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Il16O54824 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Il16O54824 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Il16O54824 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Il16O54824 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Il16O54824 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
Il16O54824 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Il16O54824 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Il16O54824 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Il16O54824 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
Il16O54824 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Il16O54824 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Il16O54824 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
Il16O54824 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Il16O54824 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Il16O54824 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Il16O54824 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
Il16O54824 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Il16O54824 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Il16O54824 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Il16O54824 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Il16O54824 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Il16O54824 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Il16O54824 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Il16O54824 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Il16O54824 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Il16O54824 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
Il16O54824 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Il16O54824 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Il16O54824 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Il16O54824 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Il16O54824 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40.88■■■■■ 4.13
Il16O54824 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
Il16O54824 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
Il16O54824 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
Il16O54824 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Il16O54824 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Il16O54824 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Il16O54824 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Il16O54824 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Il16O54824 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Il16O54824 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Il16O54824 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Il16O54824 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Il16O54824 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Il16O54824 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Il16O54824 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Il16O54824 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Il16O54824 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Il16O54824 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Il16O54824 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Il16O54824 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Il16O54824 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Il16O54824 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Il16O54824 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Il16O54824 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Il16O54824 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Il16O54824 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
Il16O54824 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Il16O54824 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Il16O54824 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Il16O54824 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
Il16O54824 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Il16O54824 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Il16O54824 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Il16O54824 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Il16O54824 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
Il16O54824 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Il16O54824 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Il16O54824 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Il16O54824 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Il16O54824 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Il16O54824 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Il16O54824 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Il16O54824 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Il16O54824 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Il16O54824 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Il16O54824 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
Il16O54824 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Il16O54824 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Il16O54824 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Il16O54824 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Il16O54824 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Il16O54824 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Il16O54824 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Il16O54824 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Il16O54824 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
Il16O54824 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Il16O54824 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Il16O54824 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Il16O54824 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms