Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CrxO54751 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CrxO54751 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CrxO54751 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CrxO54751 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CrxO54751 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CrxO54751 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CrxO54751 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrxO54751 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrxO54751 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CrxO54751 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CrxO54751 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CrxO54751 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CrxO54751 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CrxO54751 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CrxO54751 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CrxO54751 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CrxO54751 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CrxO54751 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CrxO54751 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CrxO54751 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CrxO54751 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CrxO54751 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CrxO54751 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CrxO54751 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CrxO54751 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CrxO54751 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CrxO54751 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrxO54751 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrxO54751 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CrxO54751 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CrxO54751 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CrxO54751 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CrxO54751 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CrxO54751 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CrxO54751 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CrxO54751 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CrxO54751 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CrxO54751 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CrxO54751 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CrxO54751 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CrxO54751 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CrxO54751 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CrxO54751 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CrxO54751 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CrxO54751 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CrxO54751 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CrxO54751 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CrxO54751 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxO54751 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CrxO54751 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CrxO54751 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxO54751 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxO54751 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxO54751 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxO54751 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CrxO54751 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CrxO54751 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrxO54751 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CrxO54751 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CrxO54751 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CrxO54751 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CrxO54751 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CrxO54751 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CrxO54751 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CrxO54751 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CrxO54751 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CrxO54751 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxO54751 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CrxO54751 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CrxO54751 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrxO54751 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CrxO54751 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxO54751 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CrxO54751 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CrxO54751 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrxO54751 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CrxO54751 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrxO54751 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CrxO54751 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrxO54751 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CrxO54751 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CrxO54751 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrxO54751 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CrxO54751 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CrxO54751 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CrxO54751 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CrxO54751 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CrxO54751 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CrxO54751 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrxO54751 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrxO54751 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrxO54751 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrxO54751 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CrxO54751 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxO54751 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrxO54751 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxO54751 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrxO54751 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrxO54751 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms