Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Npc1O35604 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npc1O35604 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npc1O35604 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Npc1O35604 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Npc1O35604 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Npc1O35604 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Npc1O35604 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Npc1O35604 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Npc1O35604 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Npc1O35604 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Npc1O35604 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npc1O35604 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Npc1O35604 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Npc1O35604 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Npc1O35604 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Npc1O35604 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Npc1O35604 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Npc1O35604 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Npc1O35604 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Npc1O35604 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Npc1O35604 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Npc1O35604 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Npc1O35604 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Npc1O35604 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Npc1O35604 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Npc1O35604 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Npc1O35604 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Npc1O35604 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Npc1O35604 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Npc1O35604 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Npc1O35604 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Npc1O35604 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Npc1O35604 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Npc1O35604 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Npc1O35604 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Npc1O35604 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Npc1O35604 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Npc1O35604 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Npc1O35604 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Npc1O35604 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Npc1O35604 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Npc1O35604 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Npc1O35604 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Npc1O35604 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Npc1O35604 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Npc1O35604 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Npc1O35604 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Npc1O35604 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Npc1O35604 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Npc1O35604 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Npc1O35604 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npc1O35604 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npc1O35604 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npc1O35604 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npc1O35604 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npc1O35604 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npc1O35604 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1O35604 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Npc1O35604 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npc1O35604 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npc1O35604 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npc1O35604 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npc1O35604 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Npc1O35604 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npc1O35604 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npc1O35604 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Npc1O35604 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Npc1O35604 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npc1O35604 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Npc1O35604 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Npc1O35604 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Npc1O35604 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Npc1O35604 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Npc1O35604 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Npc1O35604 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Npc1O35604 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Npc1O35604 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Npc1O35604 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Npc1O35604 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npc1O35604 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Npc1O35604 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Npc1O35604 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npc1O35604 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Npc1O35604 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Npc1O35604 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Npc1O35604 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Npc1O35604 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Npc1O35604 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Npc1O35604 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Npc1O35604 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npc1O35604 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Npc1O35604 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Npc1O35604 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Npc1O35604 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Npc1O35604 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Npc1O35604 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Npc1O35604 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npc1O35604 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Npc1O35604 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms