Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Usp17lcG5E8I7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Usp17lcG5E8I7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Usp17lcG5E8I7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Usp17lcG5E8I7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Usp17lcG5E8I7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Usp17lcG5E8I7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Usp17lcG5E8I7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Usp17lcG5E8I7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Usp17lcG5E8I7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp17lcG5E8I7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Usp17lcG5E8I7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Usp17lcG5E8I7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Usp17lcG5E8I7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp17lcG5E8I7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Usp17lcG5E8I7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Usp17lcG5E8I7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Usp17lcG5E8I7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp17lcG5E8I7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp17lcG5E8I7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp17lcG5E8I7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Usp17lcG5E8I7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp17lcG5E8I7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Usp17lcG5E8I7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Usp17lcG5E8I7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Usp17lcG5E8I7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Usp17lcG5E8I7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Usp17lcG5E8I7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Usp17lcG5E8I7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Usp17lcG5E8I7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Usp17lcG5E8I7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp17lcG5E8I7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Usp17lcG5E8I7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Usp17lcG5E8I7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp17lcG5E8I7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Usp17lcG5E8I7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Usp17lcG5E8I7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Usp17lcG5E8I7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp17lcG5E8I7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Usp17lcG5E8I7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Usp17lcG5E8I7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Usp17lcG5E8I7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Usp17lcG5E8I7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Usp17lcG5E8I7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp17lcG5E8I7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Usp17lcG5E8I7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp17lcG5E8I7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Usp17lcG5E8I7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Usp17lcG5E8I7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Usp17lcG5E8I7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Usp17lcG5E8I7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Usp17lcG5E8I7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Usp17lcG5E8I7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Usp17lcG5E8I7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp17lcG5E8I7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Usp17lcG5E8I7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Usp17lcG5E8I7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Usp17lcG5E8I7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Usp17lcG5E8I7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Usp17lcG5E8I7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Usp17lcG5E8I7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Usp17lcG5E8I7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Usp17lcG5E8I7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Usp17lcG5E8I7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Usp17lcG5E8I7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Usp17lcG5E8I7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Usp17lcG5E8I7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Usp17lcG5E8I7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Usp17lcG5E8I7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp17lcG5E8I7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Usp17lcG5E8I7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Usp17lcG5E8I7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp17lcG5E8I7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp17lcG5E8I7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Usp17lcG5E8I7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Usp17lcG5E8I7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Usp17lcG5E8I7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp17lcG5E8I7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp17lcG5E8I7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Usp17lcG5E8I7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Usp17lcG5E8I7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Usp17lcG5E8I7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp17lcG5E8I7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Usp17lcG5E8I7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Usp17lcG5E8I7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Usp17lcG5E8I7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Usp17lcG5E8I7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Usp17lcG5E8I7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Usp17lcG5E8I7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Usp17lcG5E8I7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Usp17lcG5E8I7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Usp17lcG5E8I7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Usp17lcG5E8I7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Usp17lcG5E8I7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Usp17lcG5E8I7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Usp17lcG5E8I7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Usp17lcG5E8I7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Usp17lcG5E8I7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Usp17lcG5E8I7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Usp17lcG5E8I7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
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