Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE1

Nckap5, NCK-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5E9QAE1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nckap5E9QAE1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nckap5E9QAE1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nckap5E9QAE1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nckap5E9QAE1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nckap5E9QAE1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nckap5E9QAE1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nckap5E9QAE1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nckap5E9QAE1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nckap5E9QAE1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nckap5E9QAE1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nckap5E9QAE1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nckap5E9QAE1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nckap5E9QAE1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nckap5E9QAE1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nckap5E9QAE1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nckap5E9QAE1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nckap5E9QAE1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nckap5E9QAE1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nckap5E9QAE1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nckap5E9QAE1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nckap5E9QAE1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nckap5E9QAE1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nckap5E9QAE1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nckap5E9QAE1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nckap5E9QAE1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nckap5E9QAE1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nckap5E9QAE1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nckap5E9QAE1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nckap5E9QAE1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nckap5E9QAE1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nckap5E9QAE1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nckap5E9QAE1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nckap5E9QAE1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nckap5E9QAE1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nckap5E9QAE1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nckap5E9QAE1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nckap5E9QAE1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nckap5E9QAE1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nckap5E9QAE1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nckap5E9QAE1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nckap5E9QAE1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nckap5E9QAE1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nckap5E9QAE1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nckap5E9QAE1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nckap5E9QAE1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nckap5E9QAE1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nckap5E9QAE1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nckap5E9QAE1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nckap5E9QAE1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nckap5E9QAE1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nckap5E9QAE1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5E9QAE1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap5E9QAE1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nckap5E9QAE1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5E9QAE1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nckap5E9QAE1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nckap5E9QAE1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nckap5E9QAE1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5E9QAE1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nckap5E9QAE1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nckap5E9QAE1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nckap5E9QAE1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nckap5E9QAE1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5E9QAE1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nckap5E9QAE1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nckap5E9QAE1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nckap5E9QAE1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5E9QAE1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5E9QAE1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nckap5E9QAE1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nckap5E9QAE1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5E9QAE1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nckap5E9QAE1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap5E9QAE1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5E9QAE1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nckap5E9QAE1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nckap5E9QAE1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nckap5E9QAE1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nckap5E9QAE1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nckap5E9QAE1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nckap5E9QAE1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nckap5E9QAE1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nckap5E9QAE1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5E9QAE1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nckap5E9QAE1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5E9QAE1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nckap5E9QAE1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nckap5E9QAE1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Nckap5E9QAE1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nckap5E9QAE1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nckap5E9QAE1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nckap5E9QAE1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nckap5E9QAE1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nckap5E9QAE1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5E9QAE1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5E9QAE1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5E9QAE1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nckap5E9QAE1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nckap5E9QAE1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms