Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Aknad1E9Q8N6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Aknad1E9Q8N6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Aknad1E9Q8N6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Aknad1E9Q8N6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Aknad1E9Q8N6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Aknad1E9Q8N6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Aknad1E9Q8N6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Aknad1E9Q8N6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Aknad1E9Q8N6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Aknad1E9Q8N6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Aknad1E9Q8N6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Aknad1E9Q8N6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Aknad1E9Q8N6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Aknad1E9Q8N6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Aknad1E9Q8N6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Aknad1E9Q8N6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Aknad1E9Q8N6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Aknad1E9Q8N6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Aknad1E9Q8N6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Aknad1E9Q8N6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Aknad1E9Q8N6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Aknad1E9Q8N6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Aknad1E9Q8N6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Aknad1E9Q8N6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Aknad1E9Q8N6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Aknad1E9Q8N6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Aknad1E9Q8N6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Aknad1E9Q8N6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Aknad1E9Q8N6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Aknad1E9Q8N6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Aknad1E9Q8N6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Aknad1E9Q8N6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Aknad1E9Q8N6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Aknad1E9Q8N6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Aknad1E9Q8N6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Aknad1E9Q8N6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aknad1E9Q8N6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aknad1E9Q8N6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aknad1E9Q8N6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Aknad1E9Q8N6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Aknad1E9Q8N6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Aknad1E9Q8N6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Aknad1E9Q8N6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Aknad1E9Q8N6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Aknad1E9Q8N6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Aknad1E9Q8N6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Aknad1E9Q8N6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Aknad1E9Q8N6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Aknad1E9Q8N6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Aknad1E9Q8N6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Aknad1E9Q8N6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
Aknad1E9Q8N6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Aknad1E9Q8N6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Aknad1E9Q8N6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Aknad1E9Q8N6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Aknad1E9Q8N6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Aknad1E9Q8N6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Aknad1E9Q8N6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Aknad1E9Q8N6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Aknad1E9Q8N6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Aknad1E9Q8N6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Aknad1E9Q8N6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Aknad1E9Q8N6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Aknad1E9Q8N6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Aknad1E9Q8N6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Aknad1E9Q8N6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Aknad1E9Q8N6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Aknad1E9Q8N6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Aknad1E9Q8N6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Aknad1E9Q8N6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Aknad1E9Q8N6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Aknad1E9Q8N6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Aknad1E9Q8N6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Aknad1E9Q8N6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Aknad1E9Q8N6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Aknad1E9Q8N6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Aknad1E9Q8N6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Aknad1E9Q8N6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Aknad1E9Q8N6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Aknad1E9Q8N6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Aknad1E9Q8N6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Aknad1E9Q8N6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Aknad1E9Q8N6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Aknad1E9Q8N6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Aknad1E9Q8N6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Aknad1E9Q8N6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Aknad1E9Q8N6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Aknad1E9Q8N6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Aknad1E9Q8N6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Aknad1E9Q8N6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Aknad1E9Q8N6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Aknad1E9Q8N6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Aknad1E9Q8N6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Aknad1E9Q8N6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
Aknad1E9Q8N6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Aknad1E9Q8N6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Aknad1E9Q8N6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Aknad1E9Q8N6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Aknad1E9Q8N6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms