Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
Myo5cE9Q1F5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Myo5cE9Q1F5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Myo5cE9Q1F5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
Myo5cE9Q1F5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
Myo5cE9Q1F5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Myo5cE9Q1F5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Myo5cE9Q1F5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Myo5cE9Q1F5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Myo5cE9Q1F5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Myo5cE9Q1F5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
Myo5cE9Q1F5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Myo5cE9Q1F5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
Myo5cE9Q1F5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Myo5cE9Q1F5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Myo5cE9Q1F5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
Myo5cE9Q1F5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Myo5cE9Q1F5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Myo5cE9Q1F5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Myo5cE9Q1F5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Myo5cE9Q1F5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Myo5cE9Q1F5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Myo5cE9Q1F5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Myo5cE9Q1F5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Myo5cE9Q1F5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Myo5cE9Q1F5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Myo5cE9Q1F5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Myo5cE9Q1F5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Myo5cE9Q1F5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Myo5cE9Q1F5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Myo5cE9Q1F5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Myo5cE9Q1F5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Myo5cE9Q1F5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Myo5cE9Q1F5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Myo5cE9Q1F5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Myo5cE9Q1F5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Myo5cE9Q1F5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Myo5cE9Q1F5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Myo5cE9Q1F5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Myo5cE9Q1F5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Myo5cE9Q1F5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Myo5cE9Q1F5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Myo5cE9Q1F5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Myo5cE9Q1F5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Myo5cE9Q1F5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Myo5cE9Q1F5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Myo5cE9Q1F5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Myo5cE9Q1F5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Myo5cE9Q1F5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Myo5cE9Q1F5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Myo5cE9Q1F5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Myo5cE9Q1F5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Myo5cE9Q1F5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Myo5cE9Q1F5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Myo5cE9Q1F5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Myo5cE9Q1F5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Myo5cE9Q1F5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Myo5cE9Q1F5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Myo5cE9Q1F5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Myo5cE9Q1F5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Myo5cE9Q1F5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Myo5cE9Q1F5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Myo5cE9Q1F5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Myo5cE9Q1F5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Myo5cE9Q1F5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
Myo5cE9Q1F5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Myo5cE9Q1F5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
Myo5cE9Q1F5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Myo5cE9Q1F5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Myo5cE9Q1F5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Myo5cE9Q1F5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Myo5cE9Q1F5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
Myo5cE9Q1F5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Myo5cE9Q1F5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Myo5cE9Q1F5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Myo5cE9Q1F5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
Myo5cE9Q1F5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
Myo5cE9Q1F5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Myo5cE9Q1F5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
Myo5cE9Q1F5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
Myo5cE9Q1F5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Myo5cE9Q1F5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
Myo5cE9Q1F5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Myo5cE9Q1F5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
Myo5cE9Q1F5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Myo5cE9Q1F5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
Myo5cE9Q1F5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Myo5cE9Q1F5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Myo5cE9Q1F5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Myo5cE9Q1F5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Myo5cE9Q1F5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Myo5cE9Q1F5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Myo5cE9Q1F5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Myo5cE9Q1F5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
Myo5cE9Q1F5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Myo5cE9Q1F5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Myo5cE9Q1F5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Myo5cE9Q1F5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Myo5cE9Q1F5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
Myo5cE9Q1F5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms