Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r68E9Q0V3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r68E9Q0V3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r68E9Q0V3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r68E9Q0V3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r68E9Q0V3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vmn1r68E9Q0V3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r68E9Q0V3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r68E9Q0V3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r68E9Q0V3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r68E9Q0V3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r68E9Q0V3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r68E9Q0V3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r68E9Q0V3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r68E9Q0V3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r68E9Q0V3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r68E9Q0V3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r68E9Q0V3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r68E9Q0V3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r68E9Q0V3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r68E9Q0V3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r68E9Q0V3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r68E9Q0V3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r68E9Q0V3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r68E9Q0V3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r68E9Q0V3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r68E9Q0V3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r68E9Q0V3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r68E9Q0V3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r68E9Q0V3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r68E9Q0V3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r68E9Q0V3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r68E9Q0V3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r68E9Q0V3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r68E9Q0V3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r68E9Q0V3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r68E9Q0V3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r68E9Q0V3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r68E9Q0V3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r68E9Q0V3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r68E9Q0V3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r68E9Q0V3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r68E9Q0V3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r68E9Q0V3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r68E9Q0V3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r68E9Q0V3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r68E9Q0V3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r68E9Q0V3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r68E9Q0V3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r68E9Q0V3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r68E9Q0V3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r68E9Q0V3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r68E9Q0V3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r68E9Q0V3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r68E9Q0V3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r68E9Q0V3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r68E9Q0V3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r68E9Q0V3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r68E9Q0V3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r68E9Q0V3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r68E9Q0V3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r68E9Q0V3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r68E9Q0V3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r68E9Q0V3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r68E9Q0V3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r68E9Q0V3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r68E9Q0V3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r68E9Q0V3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r68E9Q0V3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r68E9Q0V3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r68E9Q0V3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vmn1r68E9Q0V3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r68E9Q0V3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms