Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC48.66■■■■■ 5.38
Rsf1E9PWW9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
Rsf1E9PWW9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
Rsf1E9PWW9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
Rsf1E9PWW9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
Rsf1E9PWW9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
Rsf1E9PWW9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
Rsf1E9PWW9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
Rsf1E9PWW9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
Rsf1E9PWW9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC48.54■■■■■ 5.36
Rsf1E9PWW9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
Rsf1E9PWW9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.47■■■■■ 5.35
Rsf1E9PWW9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
Rsf1E9PWW9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
Rsf1E9PWW9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
Rsf1E9PWW9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
Rsf1E9PWW9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
Rsf1E9PWW9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
Rsf1E9PWW9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
Rsf1E9PWW9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
Rsf1E9PWW9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC48.05■■■■■ 5.28
Rsf1E9PWW9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.28
Rsf1E9PWW9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
Rsf1E9PWW9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC47.98■■■■■ 5.27
Rsf1E9PWW9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
Rsf1E9PWW9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC47.92■■■■■ 5.26
Rsf1E9PWW9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
Rsf1E9PWW9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
Rsf1E9PWW9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Rsf1E9PWW9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Rsf1E9PWW9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
Rsf1E9PWW9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Rsf1E9PWW9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
Rsf1E9PWW9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
Rsf1E9PWW9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
Rsf1E9PWW9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC47.59■■■■■ 5.21
Rsf1E9PWW9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC47.58■■■■■ 5.21
Rsf1E9PWW9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC47.58■■■■■ 5.21
Rsf1E9PWW9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC47.58■■■■■ 5.21
Rsf1E9PWW9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Rsf1E9PWW9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Rsf1E9PWW9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Rsf1E9PWW9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Rsf1E9PWW9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
Rsf1E9PWW9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
Rsf1E9PWW9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
Rsf1E9PWW9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC47.4■■■■■ 5.18
Rsf1E9PWW9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
Rsf1E9PWW9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
Rsf1E9PWW9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
Rsf1E9PWW9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
Rsf1E9PWW9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
Rsf1E9PWW9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC47.15■■■■■ 5.14
Rsf1E9PWW9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
Rsf1E9PWW9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
Rsf1E9PWW9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
Rsf1E9PWW9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC47.06■■■■■ 5.12
Rsf1E9PWW9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC47.06■■■■■ 5.12
Rsf1E9PWW9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.04■■■■■ 5.12
Rsf1E9PWW9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
Rsf1E9PWW9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
Rsf1E9PWW9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
Rsf1E9PWW9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
Rsf1E9PWW9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
Rsf1E9PWW9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
Rsf1E9PWW9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Rsf1E9PWW9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC46.9■■■■■ 5.1
Rsf1E9PWW9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC46.89■■■■■ 5.1
Rsf1E9PWW9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC46.8■■■■■ 5.08
Rsf1E9PWW9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Rsf1E9PWW9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
Rsf1E9PWW9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
Rsf1E9PWW9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
Rsf1E9PWW9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
Rsf1E9PWW9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
Rsf1E9PWW9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
Rsf1E9PWW9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Rsf1E9PWW9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Rsf1E9PWW9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
Rsf1E9PWW9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Rsf1E9PWW9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Rsf1E9PWW9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC46.5■■■■■ 5.03
Rsf1E9PWW9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Rsf1E9PWW9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Rsf1E9PWW9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC46.45■■■■■ 5.03
Rsf1E9PWW9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
Rsf1E9PWW9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC46.36■■■■■ 5.01
Rsf1E9PWW9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
Rsf1E9PWW9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC46.34■■■■■ 5.01
Rsf1E9PWW9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC46.33■■■■■ 5.01
Rsf1E9PWW9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC46.31■■■■■ 5
Rsf1E9PWW9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Rsf1E9PWW9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Rsf1E9PWW9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Rsf1E9PWW9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Rsf1E9PWW9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Rsf1E9PWW9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
Rsf1E9PWW9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
Rsf1E9PWW9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Rsf1E9PWW9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms